More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1154 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  95.36 
 
 		 323 aa  647    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  94.43 
 
 		 323 aa  642    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 323 aa  672    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 		 325 aa  361  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 326 aa  325  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 333 aa  316  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 326 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 329 aa  315  7e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 330 aa  315  9e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  45.82 
 
 		 331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 331 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 330 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 332 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 342 aa  301  9e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 328 aa  298  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 329 aa  298  9e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 329 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 348 aa  295  7e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 330 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 340 aa  292  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 373 aa  275  6e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 405 aa  275  7e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 331 aa  272  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1608  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.342366  normal  0.0200514 
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 352 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 356 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 356 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3078  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 337 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6886  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.447251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1704  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1037  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  41.54 
 
 		 342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0653  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00257706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.66 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1317  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0172213  normal  0.0239999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.66 
 
 		 340 aa  228  8e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1867  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 370 aa  228  9e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705084  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12310  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 358 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.846679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2993  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0321948  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0390  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3085  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 345 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.424246 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3535  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0269  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00577656  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4407  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 340 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1393  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 363 aa  222  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3969  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216039  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2075  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00113563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2051  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0220  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0501  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.08 
 
 		 366 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0383  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 332 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1993  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.88 
 
 		 340 aa  219  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0015923  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0020  tryptophan--tRNA ligase  37.85 
 
 		 363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0938  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.468666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5332  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 354 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 337 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2957  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0001475  decreased coverage  0.00015273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>