More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1153 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  95.23 
 
 
398 aa  796    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  100 
 
 
398 aa  829    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  96.48 
 
 
398 aa  805    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  58.09 
 
 
405 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  56.92 
 
 
399 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  58.59 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  54.55 
 
 
390 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  57.22 
 
 
387 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  53.63 
 
 
397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  55.12 
 
 
393 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  52.88 
 
 
387 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  54.2 
 
 
396 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  54.31 
 
 
404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  54.43 
 
 
396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  53.79 
 
 
386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  54.71 
 
 
393 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  54.86 
 
 
387 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  53.73 
 
 
388 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  53.94 
 
 
396 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  52.62 
 
 
407 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  53.69 
 
 
396 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  53.69 
 
 
396 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  53.44 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  53.69 
 
 
396 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  53.93 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  53.69 
 
 
396 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  52.23 
 
 
391 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  54.45 
 
 
396 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  52.51 
 
 
390 aa  436  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  54.03 
 
 
390 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  52.37 
 
 
388 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  52.42 
 
 
396 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  54.86 
 
 
388 aa  428  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  52.09 
 
 
396 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  54.86 
 
 
393 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  53.02 
 
 
386 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  52.76 
 
 
391 aa  426  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  49.36 
 
 
392 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  49.87 
 
 
392 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  52.08 
 
 
395 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 
400 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  52.34 
 
 
386 aa  415  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  51.7 
 
 
402 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  52.08 
 
 
410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  49.22 
 
 
385 aa  401  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  47.79 
 
 
387 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  47.52 
 
 
388 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  49.09 
 
 
386 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  47.14 
 
 
385 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  47.77 
 
 
381 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  48.7 
 
 
385 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  48.55 
 
 
383 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  47.77 
 
 
380 aa  365  1e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  48.16 
 
 
381 aa  361  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  42.04 
 
 
387 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  42.04 
 
 
387 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  41.88 
 
 
387 aa  315  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  41.78 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  41.78 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  41.36 
 
 
387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  41.1 
 
 
387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  41.51 
 
 
385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  41.62 
 
 
387 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  40.99 
 
 
387 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  40.94 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  42.19 
 
 
385 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  41.1 
 
 
382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  39.95 
 
 
370 aa  299  6e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  38.69 
 
 
399 aa  297  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  38.06 
 
 
398 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 
386 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  42.22 
 
 
401 aa  295  7e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  40.11 
 
 
394 aa  293  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  41.11 
 
 
392 aa  290  4e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  42.25 
 
 
367 aa  290  4e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 
398 aa  289  6e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  40.11 
 
 
387 aa  288  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  40.58 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  40.73 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  41.69 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 
395 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 
395 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 
395 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 
395 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 
395 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  37.5 
 
 
401 aa  282  6.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  40.36 
 
 
387 aa  282  7.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  38.36 
 
 
395 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 
395 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  40.16 
 
 
388 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  39.42 
 
 
375 aa  281  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  40 
 
 
398 aa  280  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  39.59 
 
 
401 aa  281  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  40.68 
 
 
379 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  38.62 
 
 
395 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  40.71 
 
 
395 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  38.36 
 
 
395 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 
388 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  38.83 
 
 
395 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  39.95 
 
 
389 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>