More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1137 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 84 aa  172  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  98.81 
 
 		 84 aa  169  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  97.62 
 
 		 84 aa  167  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 83 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  72.46 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 91 aa  107  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 93 aa  107  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  65.85 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1899  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.617273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0841  ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.82493e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  67.14 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 95 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0246  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000945082  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 100 aa  103  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  62.03 
 
 		 87 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1030  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 84 aa  103  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011666  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  61.04 
 
 		 89 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0863  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0966779  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  60.98 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2012  ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 83 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441981  unclonable  3.43128e-16 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 92 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  56.1 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  68.12 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1509  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00258122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1712  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.592545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  68.12 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  68.12 
 
 		 85 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  58.02 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  57.32 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  59.76 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  68.12 
 
 		 85 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>