More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1102 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1074  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  79.88 
 
 		 169 aa  263  7e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.779028  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  80.36 
 
 		 169 aa  262  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  47.17 
 
 		 436 aa  142  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  51.13 
 
 		 371 aa  139  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  49.36 
 
 		 413 aa  137  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  48.67 
 
 		 415 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  51.43 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  50.36 
 
 		 420 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  42.46 
 
 		 411 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  44.3 
 
 		 408 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  46.9 
 
 		 415 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  44.3 
 
 		 408 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  46.31 
 
 		 415 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  46.05 
 
 		 412 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  40.54 
 
 		 400 aa  124  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  48.28 
 
 		 413 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  44.08 
 
 		 420 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  45.95 
 
 		 413 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  45.45 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1676  competence damage-inducible protein A  50.65 
 
 		 418 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  42.95 
 
 		 414 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  46.85 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  47.76 
 
 		 432 aa  117  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  54.39 
 
 		 417 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  37.66 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  43.45 
 
 		 413 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  43.67 
 
 		 408 aa  117  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  43.24 
 
 		 413 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  46.75 
 
 		 421 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  42.04 
 
 		 417 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  42.48 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  44.05 
 
 		 416 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  42.48 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  42.48 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0456  competence/damage-inducible protein CinA  50.42 
 
 		 423 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 		 411 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  44.93 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  40.94 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  45.51 
 
 		 420 aa  114  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  44.05 
 
 		 416 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  48.55 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  36.67 
 
 		 413 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  43.87 
 
 		 417 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0246  competence-damaged protein  42.77 
 
 		 424 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.77 
 
 		 408 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  41.61 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  41.88 
 
 		 415 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2662  competence damage-inducible protein A  43.87 
 
 		 425 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  43.23 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  40.38 
 
 		 414 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  43.84 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  40.41 
 
 		 403 aa  108  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40 
 
 		 431 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  40.94 
 
 		 412 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  43.88 
 
 		 208 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  41.67 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  42.86 
 
 		 419 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  39.86 
 
 		 414 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3733  CinA domain-containing protein  40.49 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000115453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  38.06 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  42.45 
 
 		 203 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  43.17 
 
 		 208 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  40.24 
 
 		 423 aa  104  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  43.88 
 
 		 208 aa  104  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  40.27 
 
 		 412 aa  104  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2606  CinA domain protein  41.29 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  0.640743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  43.17 
 
 		 202 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  45 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4017  competence/damage-inducible protein CinA  41.18 
 
 		 424 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0850311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  41.38 
 
 		 433 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  43.17 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1484  CinA domain-containing protein  38.41 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3016  CinA domain protein  41.94 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.850522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  33.54 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  38.89 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0735  competence/damage-inducible protein cinA  48.65 
 
 		 414 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000607251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  41.46 
 
 		 429 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  43.17 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2180  competence/damage-inducible protein CinA  41.48 
 
 		 423 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  38.26 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  36.13 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  40.38 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  47.2 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3712  competence/damage-inducible protein CinA  40.52 
 
 		 425 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0233  competence/damage-inducible protein CinA  40.52 
 
 		 425 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3908  competence/damage-inducible protein CinA  40.52 
 
 		 425 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0252  competence/damage-inducible protein CinA  40.51 
 
 		 424 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  43.54 
 
 		 425 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  39.47 
 
 		 186 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0272  competence/damage-inducible protein CinA  39.87 
 
 		 424 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 420 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  38.56 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3402  CinA domain protein  38.51 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109005  normal  0.0764099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  41.45 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.41 
 
 		 433 aa  101  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1960  CinA domain-containing protein  38.61 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0069  CinA family protein  39.74 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4089  CinA domain-containing protein  37.75 
 
 		 160 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  41.48 
 
 		 411 aa  101  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>