133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0995 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  100 
 
 
215 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  92.09 
 
 
215 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  8.44147e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  91.63 
 
 
215 aa  370  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  3.30178e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2086  BioY protein  38.42 
 
 
197 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00325943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  36.27 
 
 
199 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  37.82 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  37.43 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  31.49 
 
 
190 aa  95.5  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  4.21582e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  36.42 
 
 
187 aa  91.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  37.89 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  38.41 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  38.65 
 
 
191 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  32.52 
 
 
197 aa  83.6  2e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  36.53 
 
 
197 aa  83.6  2e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  33.73 
 
 
205 aa  80.5  2e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  31.12 
 
 
187 aa  78.2  9e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  32.61 
 
 
195 aa  77  2e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  32.45 
 
 
205 aa  75.5  5e-13  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  35.47 
 
 
185 aa  75.5  6e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  35.19 
 
 
203 aa  75.1  8e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  29.84 
 
 
184 aa  74.3  1e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  34.42 
 
 
178 aa  74.3  1e-12  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  37.04 
 
 
197 aa  74.3  1e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  32.65 
 
 
192 aa  74.3  1e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  33.76 
 
 
206 aa  73.6  2e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  36.54 
 
 
198 aa  70.5  2e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  2.83482e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  35.54 
 
 
196 aa  70.5  2e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  30.57 
 
 
205 aa  70.1  2e-11  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  37.06 
 
 
210 aa  70.5  2e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  31.33 
 
 
184 aa  68.9  6e-11  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.66759e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  31.33 
 
 
182 aa  68.6  7e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.40294e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  34.18 
 
 
145 aa  67.8  1e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  30.73 
 
 
212 aa  66.6  2e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  33.96 
 
 
169 aa  67  2e-10  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  33.96 
 
 
169 aa  67  2e-10  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  30.23 
 
 
165 aa  66.6  3e-10  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  38.41 
 
 
203 aa  66.6  3e-10  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  36.02 
 
 
200 aa  65.9  4e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  39.47 
 
 
195 aa  65.1  8e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  37.36 
 
 
197 aa  64.7  9e-10  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  31.13 
 
 
182 aa  64.3  1e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  31.28 
 
 
203 aa  64.3  1e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.63296e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  32.45 
 
 
184 aa  63.5  2e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  31.21 
 
 
182 aa  63.5  2e-09  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.2911e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  36.02 
 
 
199 aa  63.5  2e-09  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  32.45 
 
 
184 aa  63.5  2e-09  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  27.61 
 
 
184 aa  63.2  3e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  36.36 
 
 
185 aa  62.8  4e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  29.81 
 
 
231 aa  62.8  4e-09  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  32.39 
 
 
199 aa  62  7e-09  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  32.39 
 
 
199 aa  62  7e-09  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  34.23 
 
 
169 aa  61.6  9e-09  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  40.74 
 
 
189 aa  61.2  1e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_002620  TC0638  BioY family protein  30.54 
 
 
196 aa  61.2  1e-08  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.532905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  33.12 
 
 
189 aa  60.5  2e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  32.03 
 
 
179 aa  60.1  2e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  32.72 
 
 
191 aa  59.7  3e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  32.72 
 
 
191 aa  59.7  3e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0693  BioY protein  32.39 
 
 
199 aa  59.7  3e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  31.79 
 
 
187 aa  58.9  5e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  34.02 
 
 
208 aa  58.9  6e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  3.26686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  37.58 
 
 
187 aa  58.5  8e-08  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  35.62 
 
 
189 aa  58.2  9e-08  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  32.45 
 
 
208 aa  57.8  1e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  34.12 
 
 
200 aa  57.8  1e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  30.63 
 
 
190 aa  57.4  2e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1704  BioY protein  34.73 
 
 
200 aa  56.6  2e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00848972  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  35.03 
 
 
207 aa  57.4  2e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  30.91 
 
 
216 aa  57  2e-07  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3254e-06 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  30.67 
 
 
191 aa  57.4  2e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  31.03 
 
 
182 aa  56.6  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  3.03529e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  32.93 
 
 
189 aa  55.8  4e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  29.25 
 
 
182 aa  54.3  1e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.97008e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02210  hypothetical protein  31.35 
 
 
194 aa  54.7  1e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  30.41 
 
 
187 aa  54.3  1e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  35.23 
 
 
224 aa  53.5  2e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  30.38 
 
 
187 aa  53.9  2e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.05792e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  33.71 
 
 
195 aa  53.1  3e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  32.93 
 
 
169 aa  52.4  5e-06  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  29.41 
 
 
192 aa  52.4  6e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.69732e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  31.74 
 
 
187 aa  52.4  6e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  42.17 
 
 
182 aa  52  7e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  27.44 
 
 
187 aa  52  7e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  29.45 
 
 
197 aa  51.6  9e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  29.3 
 
 
167 aa  51.6  9e-06  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  1.11141e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  32.75 
 
 
181 aa  50.8  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  29.81 
 
 
193 aa  51.6  1e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  31.91 
 
 
169 aa  51.6  1e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  30.25 
 
 
175 aa  50.8  2e-05  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  28.89 
 
 
176 aa  50.1  2e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  26.59 
 
 
187 aa  50.4  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.89963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  27.54 
 
 
179 aa  50.4  2e-05  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  9.49175e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  28.85 
 
 
182 aa  49.7  3e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  29.33 
 
 
198 aa  49.7  3e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2356  BioY protein  33.95 
 
 
200 aa  49.7  4e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1597  hypothetical protein  36.17 
 
 
177 aa  49.3  4e-05  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  27.91 
 
 
184 aa  48.9  5e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  28.67 
 
 
179 aa  48.9  5e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.4315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  25.5 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0508  BioY protein  31.65 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>