More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0856 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0856  membrane protein  100 
 
 
210 aa  418  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000027794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0965  membrane protein  95.71 
 
 
210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000215591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_838  hypothetical protein  96.19 
 
 
210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000326909  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  37.64 
 
 
197 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  39.01 
 
 
197 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  39.01 
 
 
197 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  33.5 
 
 
200 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  31.89 
 
 
198 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_8  hypothetical protein  34.52 
 
 
212 aa  99  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0008  membrane protein  35.83 
 
 
200 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  45.76 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  39.42 
 
 
195 aa  96.3  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.82 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  41.01 
 
 
200 aa  94  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1357  membrane protein  42.28 
 
 
232 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  34.52 
 
 
207 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1493  hypothetical protein  41.41 
 
 
232 aa  91.3  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0008  membrane protein  36.92 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  39.72 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  31.19 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1226  hypothetical protein  47 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784525  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  36.75 
 
 
201 aa  89.4  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  32.97 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  29.15 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  36.27 
 
 
214 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  38.61 
 
 
205 aa  88.2  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1217  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.69 
 
 
195 aa  87.8  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1445  hypothetical protein  45 
 
 
185 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000632214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  35.29 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  32.42 
 
 
198 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  39.33 
 
 
219 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  37.58 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.79 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  40.46 
 
 
194 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  38.12 
 
 
222 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  42.52 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  37.68 
 
 
204 aa  84.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  33.88 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  28.73 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.52 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.54 
 
 
216 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1778  membrane protein  38.51 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0375425 
 
 
-
 
NC_002936  DET1611  membrane protein  42.19 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  35.07 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  29.74 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.93 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.44 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  36.23 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.1 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  31.82 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  36.43 
 
 
190 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  34.15 
 
 
235 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.62 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  36.43 
 
 
190 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.56 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  29.02 
 
 
200 aa  82  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.46 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  30.68 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3589  membrane protein  33.33 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.933986  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  26.48 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.71 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.71 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.89 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2130  protein of unknown function DUF205  32.06 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0982  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  27.95 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00892107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  29.67 
 
 
209 aa  79  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  32.64 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  39.68 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  30.41 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  33.18 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  30.95 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  28.72 
 
 
196 aa  79  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.5 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  32.93 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  32.48 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.04 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  34.18 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.24 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  32.58 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1442  hypothetical protein  38.4 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  43.64 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  42.73 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0724  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.71 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  31.34 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1415  hypothetical protein  38.4 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.06877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07580  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.71 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0346741 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  35 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  31.1 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.83 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0684  protein of unknown function DUF205  31.89 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  28.04 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  37.04 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  32.63 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  36.5 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>