More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0808 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 200 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  94 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  95 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  66 
 
 		 184 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  66.67 
 
 		 226 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  66.67 
 
 		 264 aa  215  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  66.67 
 
 		 271 aa  214  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  67.35 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  63.95 
 
 		 216 aa  212  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  63.64 
 
 		 268 aa  210  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  63.19 
 
 		 264 aa  209  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  64.63 
 
 		 199 aa  208  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  62.94 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.42 
 
 		 180 aa  204  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  62.16 
 
 		 182 aa  204  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  60.81 
 
 		 183 aa  204  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  61.74 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.54 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  60.53 
 
 		 173 aa  201  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.74 
 
 		 184 aa  201  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  61.07 
 
 		 184 aa  201  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 		 213 aa  201  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  61.07 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  61.07 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  61.07 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  60.42 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.67 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.72 
 
 		 183 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.68 
 
 		 179 aa  198  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.43 
 
 		 183 aa  198  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  59.33 
 
 		 184 aa  197  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  61.97 
 
 		 179 aa  197  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  59.33 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  61.97 
 
 		 174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  61.22 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  60.54 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.67 
 
 		 184 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 		 159 aa  195  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  59.33 
 
 		 183 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 		 159 aa  194  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  59.06 
 
 		 183 aa  194  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 		 159 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.72 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  59.21 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  61.22 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  59.03 
 
 		 167 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 		 160 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 		 160 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 		 251 aa  191  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.43 
 
 		 202 aa  191  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  59.33 
 
 		 158 aa  191  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  58.33 
 
 		 167 aa  191  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.55 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  56.46 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0270  NADH dehydrogenase subunit B  54.75 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58 
 
 		 183 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0241  NADH dehydrogenase subunit B  54.75 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.92 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  59.06 
 
 		 170 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 		 158 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  59.15 
 
 		 172 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 		 158 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58 
 
 		 158 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 		 158 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  45.77 
 
 		 250 aa  188  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.41 
 
 		 169 aa  188  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  60.43 
 
 		 166 aa  188  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.99 
 
 		 170 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  58.67 
 
 		 158 aa  187  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  59.33 
 
 		 158 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  52.72 
 
 		 184 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.59 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  59.33 
 
 		 170 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.28 
 
 		 170 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  57.72 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  57.72 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01288  NADH dehydrogenase subunit B  52.46 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  57.33 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 		 158 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  56.67 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1494  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  58.45 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.55 
 
 		 170 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>