51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0800 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  632  1e-180  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  91.39 
 
 
302 aa  590  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  85.43 
 
 
302 aa  560  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  38.87 
 
 
276 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  38.46 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  38.06 
 
 
276 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  30.08 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  28.81 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  25.94 
 
 
251 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  27.46 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  26.53 
 
 
250 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  26.4 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  26.64 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  23.23 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  24.64 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  23.01 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  22.59 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  23.01 
 
 
250 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  23.39 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  26.1 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  20.06 
 
 
299 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  22.98 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  22.44 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  26.4 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  24.52 
 
 
256 aa  59.7  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  24.79 
 
 
251 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  25.63 
 
 
235 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  25.63 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  25.19 
 
 
288 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  24.05 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  23.02 
 
 
281 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  24.78 
 
 
226 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  27.16 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  22 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  22.18 
 
 
248 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  22.68 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  23.86 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  21.31 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  20.14 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  25.44 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  21.27 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  20.13 
 
 
284 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  22.3 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  20.31 
 
 
296 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  20.96 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  22.11 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  21.01 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  23.9 
 
 
285 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  21.78 
 
 
245 aa  42.7  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  21.58 
 
 
286 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  20.24 
 
 
234 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>