218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0742 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  88.89 
 
 		 486 aa  906    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  1005    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  90.95 
 
 		 486 aa  893    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  57.56 
 
 		 484 aa  578  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  56.06 
 
 		 486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  56.67 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  55.65 
 
 		 477 aa  565  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  57.53 
 
 		 480 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  57.74 
 
 		 480 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  56.49 
 
 		 480 aa  554  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  55.86 
 
 		 482 aa  550  1e-155  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  54.28 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  56.58 
 
 		 480 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  53.54 
 
 		 484 aa  531  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  54.18 
 
 		 480 aa  530  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  52.92 
 
 		 484 aa  525  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  52.5 
 
 		 498 aa  527  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  55.53 
 
 		 473 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  53.96 
 
 		 484 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  54.39 
 
 		 477 aa  511  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  53.56 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  49.27 
 
 		 482 aa  501  1e-140  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  50.1 
 
 		 482 aa  495  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  50.94 
 
 		 493 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  50.83 
 
 		 484 aa  497  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  53.54 
 
 		 477 aa  488  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  49.37 
 
 		 474 aa  488  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  53.97 
 
 		 477 aa  487  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  49.79 
 
 		 474 aa  488  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  49.9 
 
 		 481 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  50.52 
 
 		 485 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  48.97 
 
 		 485 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  50.52 
 
 		 485 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  50 
 
 		 486 aa  477  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  50.11 
 
 		 460 aa  477  1e-133  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  49.69 
 
 		 486 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  49.49 
 
 		 485 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  52.92 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  48.13 
 
 		 486 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  47.93 
 
 		 486 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  50.82 
 
 		 487 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  49.27 
 
 		 488 aa  458  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  50.41 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  50.82 
 
 		 487 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  55.9 
 
 		 988 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  49.69 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  51.14 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  48.23 
 
 		 488 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  48.64 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  47.29 
 
 		 477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  49.58 
 
 		 476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  48.12 
 
 		 477 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  48.43 
 
 		 476 aa  445  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  50.21 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  46.69 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  52.99 
 
 		 963 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  48.25 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  47.08 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  47.5 
 
 		 476 aa  435  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  47.6 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  48.84 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  51.94 
 
 		 432 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  47.81 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  50.21 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  47.51 
 
 		 476 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  50 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  47.08 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  45.13 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  49.16 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  47.19 
 
 		 473 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  47.84 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  45.03 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  44.14 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  49.46 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  41.23 
 
 		 462 aa  332  6e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  39.44 
 
 		 447 aa  307  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  32.26 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  31.83 
 
 		 511 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3555  hypothetical protein  29.81 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.771976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  29.6 
 
 		 466 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  31.97 
 
 		 514 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  30.66 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  29.41 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  30.86 
 
 		 395 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  28.57 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  29.93 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  30.97 
 
 		 472 aa  146  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  30.88 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  29.37 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  29.41 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  29.21 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  30.65 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  29.19 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  29.6 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4862  hypothetical protein  31.39 
 
 		 382 aa  144  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0844197 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  29.15 
 
 		 408 aa  144  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  29.03 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  29.37 
 
 		 398 aa  143  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  30.65 
 
 		 407 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  30.65 
 
 		 407 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>