52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0741 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  279  1e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  84.06 
 
 
138 aa  238  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  78.99 
 
 
138 aa  228  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  34.56 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  35.97 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  34.78 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  35.51 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  34.53 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  34.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  31.47 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  31.65 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1580  hypothetical protein  32.35 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.986242  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  35.46 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0242  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1671  hypothetical protein  29.2 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.532408  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  30.5 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  30.28 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2360  metal dependent phosphohydrolase  34.59 
 
 
542 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  27.46 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  31.43 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  27.97 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0957  archease family protein  27.74 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.395937  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  31.25 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1546  hypothetical protein  28.99 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0373  protein of unknown function DUF101  31.34 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  30.43 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2152  hypothetical protein  31.06 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0129  hypothetical protein  26.35 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.011827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  32.59 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0902  hypothetical protein  28.46 
 
 
163 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  26.24 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1313  hypothetical protein  25.36 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223315  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1267  hypothetical cytosolic protein  30 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0479  hypothetical protein  27.94 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.541748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0332  protein of unknown function DUF101  32.14 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2756  protein of unknown function DUF101  26.28 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.905523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46270  hypothetical protein  30.71 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0232  hypothetical protein  26.71 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1729  hypothetical protein  29.5 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  25.87 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0412  protein of unknown function DUF101  36 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00074949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1680  hypothetical protein  28.89 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  28.99 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  25.9 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2126  hypothetical protein  30.09 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  25.87 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1793  hypothetical protein  24.82 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4796  protein of unknown function DUF101  29.79 
 
 
140 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0988  protein of unknown function DUF101  24.44 
 
 
143 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  24.14 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3272  protein of unknown function DUF101  24.44 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1615  hypothetical protein  27.07 
 
 
143 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.307554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>