174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0731 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  80.6 
 
 		 523 aa  867    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  83 
 
 		 500 aa  881    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  100 
 
 		 500 aa  1045    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 484 aa  263  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 510 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  29.62 
 
 		 496 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  27.98 
 
 		 586 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2408  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 		 563 aa  207  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410244  normal  0.0736984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1763  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  24.8 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.76 
 
 		 740 aa  93.2  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  25.38 
 
 		 503 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  24.52 
 
 		 522 aa  90.1  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  25.42 
 
 		 508 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 503 aa  89  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  24.04 
 
 		 938 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  22.6 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  23.67 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  23.84 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  23.64 
 
 		 501 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.61 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  21.92 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  23.83 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  23.61 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  23.45 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  23.38 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  21.25 
 
 		 496 aa  77.4  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  23.89 
 
 		 520 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  23.29 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  23 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.05 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.51 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  24.49 
 
 		 505 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  22.59 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0543  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  22.83 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116233  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  22.13 
 
 		 518 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  22.61 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  23.82 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  23.08 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  21.46 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  22.64 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.12 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  21.9 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  21.96 
 
 		 504 aa  67  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  21.75 
 
 		 504 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1896  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 		 73 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2640  amine oxidase  22.69 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1874  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.68 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  24.65 
 
 		 514 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  21.78 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.31 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  23.71 
 
 		 708 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  24.27 
 
 		 553 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  20.92 
 
 		 520 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  21.7 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  22.57 
 
 		 711 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  22.72 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  22.67 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  22.79 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  21.31 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  27.3 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  23.15 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  20.75 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  21.92 
 
 		 547 aa  59.7  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  22.41 
 
 		 549 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  21.17 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  20.66 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  20.85 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  21.06 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  25.78 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  20.58 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  22.2 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  22.7 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  22.09 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  21.3 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  23.21 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  38.46 
 
 		 499 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  23.38 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  25.76 
 
 		 556 aa  57  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  21.37 
 
 		 535 aa  57  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  19.3 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  22.79 
 
 		 514 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2059  hypothetical protein  20.35 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409241  normal  0.0351139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  20.71 
 
 		 509 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  22.16 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  20.71 
 
 		 509 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  19.1 
 
 		 499 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.16 
 
 		 532 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  22.67 
 
 		 508 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  21.7 
 
 		 511 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  22.72 
 
 		 507 aa  53.5  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  20.86 
 
 		 499 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  31.37 
 
 		 501 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  20.18 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  22.87 
 
 		 571 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  20.25 
 
 		 492 aa  53.5  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  31.25 
 
 		 505 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  20.43 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  22.93 
 
 		 519 aa  53.5  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>