24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0709 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  100 
 
 
217 aa  440  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_689  translin  95.85 
 
 
217 aa  424  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  96.19 
 
 
210 aa  410  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  50.79 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  43 
 
 
208 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0955582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  48.42 
 
 
228 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  41.06 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  41.55 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  48.4 
 
 
231 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  40.82 
 
 
223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  38.59 
 
 
208 aa  122  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  33.5 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0076  Translin  28.92 
 
 
203 aa  98.6  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0808  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.4 
 
 
205 aa  91.7  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443987  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  30.53 
 
 
197 aa  91.3  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  28.99 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0790  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.14 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0856  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.23 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1128  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.42 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0034  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.49 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0473  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.84 
 
 
189 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000815699  hitchhiker  0.006759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1593  haloacid dehalogenase superfamily protein  26.4 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0873  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.45 
 
 
204 aa  45.1  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0624  haloacid dehalogenase superfamily protein  24.31 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>