More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0697 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
393 aa  813    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  80.47 
 
 
379 aa  644    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  74.14 
 
 
379 aa  593  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 
399 aa  146  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 
386 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  27.27 
 
 
375 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  25.79 
 
 
382 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  27.12 
 
 
416 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  22.81 
 
 
391 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  23.61 
 
 
386 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.49 
 
 
396 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 
385 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  23.24 
 
 
392 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 
369 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.94 
 
 
365 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.47 
 
 
391 aa  99.8  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  23.98 
 
 
385 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 
362 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  24.02 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 
402 aa  89  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 
385 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.61 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  24.3 
 
 
398 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 
361 aa  86.7  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  23.97 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  28.37 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  23.68 
 
 
361 aa  84  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  23.94 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.61 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  24.22 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  22.87 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.66 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.07 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  25.79 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  23.77 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  24.3 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  23.71 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  24.29 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  22.91 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  26.17 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.23 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  26.29 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  23.71 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  22.85 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  22.64 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  24.03 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.59 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  26.19 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  23.64 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2805  monooxygenase FAD-binding protein  24.22 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  22.45 
 
 
406 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  25.14 
 
 
363 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  22.28 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  23.24 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.18 
 
 
445 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 
452 aa  67  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 
443 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.1 
 
 
443 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  22.58 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  24.3 
 
 
382 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  23.26 
 
 
407 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  22.47 
 
 
449 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  23.18 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  25.38 
 
 
341 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  23.6 
 
 
446 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  21.88 
 
 
457 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  21.67 
 
 
414 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  23.51 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  23.16 
 
 
431 aa  63.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  22.42 
 
 
405 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>