More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0681 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 
644 aa  636  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
644 aa  648  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 
636 aa  634  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 
596 aa  638  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
645 aa  639  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.55721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
582 aa  1212  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.23411e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 
643 aa  659  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  95.7 
 
 
582 aa  1148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  95.7 
 
 
582 aa  1146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  3.28118e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
644 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
644 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 
644 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  9.9925e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
645 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  7.4774e-09  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 
644 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 
638 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 
636 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
643 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
636 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
636 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 
644 aa  623  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 
638 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.02997e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0226  threonyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
614 aa  620  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 
648 aa  621  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 
644 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 
659 aa  620  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 
640 aa  617  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 
638 aa  617  1e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
640 aa  614  1e-174  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 
646 aa  613  1e-174  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
631 aa  610  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  4.76694e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
583 aa  609  1e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0744  threonyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
581 aa  606  1e-172  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0359075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  51.85 
 
 
635 aa  606  1e-172  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  7.17334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
649 aa  606  1e-172  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
639 aa  604  1e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.79764e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33493  predicted protein  52.06 
 
 
684 aa  604  1e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2095  threonyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
684 aa  598  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00031634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 
635 aa  601  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78172e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 
633 aa  597  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.91077e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
634 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
635 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
604 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 
647 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
637 aa  592  1e-168  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
637 aa  591  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.37846e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
635 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 
634 aa  586  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.36416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 
637 aa  580  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67344e-05 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1034  threonyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 
611 aa  581  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
638 aa  576  1e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0935  threonyl-tRNA synthetase  50.37 
 
 
611 aa  578  1e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0867221  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
636 aa  577  1e-163  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
649 aa  573  1e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  51.55 
 
 
639 aa  573  1e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
652 aa  572  1e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
645 aa  569  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_46103  predicted protein  51.25 
 
 
564 aa  568  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.036188 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 
645 aa  569  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3269  threonyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
657 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
635 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.83369e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
644 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.86283e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
605 aa  566  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  7.16431e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
646 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
648 aa  563  1e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
662 aa  561  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 
640 aa  559  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2108  threonyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
659 aa  559  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0349  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
595 aa  558  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129605  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
636 aa  556  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.92835e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
603 aa  557  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
645 aa  556  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2230  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
666 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883238  hitchhiker  8.34751e-06 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0841  threonine--tRNA ligase  46.06 
 
 
676 aa  557  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2078  threonyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
657 aa  558  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
643 aa  551  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  2.753e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1764  threonyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
658 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.279145  hitchhiker  0.00103927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
637 aa  549  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
640 aa  549  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
647 aa  551  1e-155  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0110  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
595 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6132  threonyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
659 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158599  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
640 aa  547  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2089  threonyl-tRNA synthetase  47.22 
 
 
682 aa  547  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
648 aa  548  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
643 aa  548  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.77582e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
659 aa  545  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
645 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3147  threonyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
701 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0448  threonyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
677 aa  544  1e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.145335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
647 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
645 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
602 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 
641 aa  544  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 
639 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  49.19 
 
 
645 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
645 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.71694e-05  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
645 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.66692e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 
645 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
637 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
637 aa  541  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>