More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0669 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  91.75 
 
 		 388 aa  750    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  91.24 
 
 		 390 aa  745    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 388 aa  798    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.64 
 
 		 392 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.79 
 
 		 391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.17 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  53.97 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  54.23 
 
 		 382 aa  444  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  51.7 
 
 		 382 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.02 
 
 		 389 aa  437  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  52.74 
 
 		 382 aa  435  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  52.63 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  56.84 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  50.79 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.52 
 
 		 385 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  50.78 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.03 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.18 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.68 
 
 		 385 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  50 
 
 		 389 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.44 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.04 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  48.04 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  48.69 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  49.48 
 
 		 384 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  47.14 
 
 		 386 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  47.92 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  43.49 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  44.71 
 
 		 403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  43.39 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  42.48 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  44.18 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  43.95 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  44.68 
 
 		 393 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  42.02 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  43.41 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  43.09 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  44.41 
 
 		 409 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  41.42 
 
 		 395 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  43.65 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  42.78 
 
 		 394 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  42.78 
 
 		 394 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  42.52 
 
 		 391 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  43.65 
 
 		 388 aa  348  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  44.65 
 
 		 425 aa  348  7e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  45.48 
 
 		 399 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  44.03 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  44.03 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  41.88 
 
 		 394 aa  345  6e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  43.24 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  44.18 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  40.89 
 
 		 391 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  41.86 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  42.11 
 
 		 405 aa  338  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  41.73 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  42.64 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  41.94 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  43.81 
 
 		 395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  42.71 
 
 		 412 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  43.58 
 
 		 406 aa  335  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  41.94 
 
 		 405 aa  335  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  42.97 
 
 		 403 aa  335  7e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  44.41 
 
 		 407 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  41.1 
 
 		 403 aa  335  9e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  42.44 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  42.44 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  42.44 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  42.44 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  42.44 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  43.09 
 
 		 400 aa  334  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  40.57 
 
 		 421 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  42.44 
 
 		 412 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  42.44 
 
 		 412 aa  333  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  42.67 
 
 		 406 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  43.77 
 
 		 418 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  42.44 
 
 		 412 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  42.44 
 
 		 412 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  42.02 
 
 		 412 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  42.44 
 
 		 412 aa  333  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  41.69 
 
 		 405 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  42.67 
 
 		 406 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  42.44 
 
 		 412 aa  333  4e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  44.01 
 
 		 392 aa  332  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  41.34 
 
 		 390 aa  332  5e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  44.01 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  44.01 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  44.01 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  44.01 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  43.5 
 
 		 405 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  42.97 
 
 		 428 aa  332  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  42.44 
 
 		 412 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  43.51 
 
 		 406 aa  332  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  43.65 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  42.25 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  41.99 
 
 		 394 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  42.22 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  43.23 
 
 		 392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5073  aminotransferase  42.67 
 
 		 409 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0054925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  41.69 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>