More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0644 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0709  trigger factor  89.29 
 
 
448 aa  817    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  90.83 
 
 
447 aa  831    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  100 
 
 
447 aa  904    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.89 
 
 
500 aa  226  8e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.63 
 
 
446 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  33.65 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  34.31 
 
 
428 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.56 
 
 
428 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  33.42 
 
 
438 aa  211  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.96 
 
 
435 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  31.52 
 
 
438 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  34.11 
 
 
427 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.01 
 
 
433 aa  203  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.79 
 
 
435 aa  202  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  32.16 
 
 
425 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.65 
 
 
425 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  31.25 
 
 
446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  31.89 
 
 
425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  31.27 
 
 
435 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.75 
 
 
433 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  31.89 
 
 
425 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  31.89 
 
 
425 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  31.89 
 
 
425 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  31.89 
 
 
425 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  31.89 
 
 
425 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.75 
 
 
433 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.31 
 
 
436 aa  196  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  30.85 
 
 
425 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  30.85 
 
 
425 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.5 
 
 
428 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  33.6 
 
 
438 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  29.04 
 
 
439 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  29.22 
 
 
428 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  29.52 
 
 
506 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  28.46 
 
 
431 aa  176  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  29.47 
 
 
431 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  29.26 
 
 
460 aa  172  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  30.66 
 
 
484 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.26 
 
 
432 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.65 
 
 
433 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  27.78 
 
 
471 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  27.84 
 
 
427 aa  169  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.74 
 
 
428 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.42 
 
 
435 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  27.6 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  26.41 
 
 
449 aa  167  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  29.44 
 
 
539 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  27.7 
 
 
500 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  25.8 
 
 
488 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.17 
 
 
435 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  29.38 
 
 
482 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  29.38 
 
 
478 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  29.38 
 
 
478 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  27.15 
 
 
433 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  25.13 
 
 
439 aa  159  9e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  27.46 
 
 
436 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  27.71 
 
 
479 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.1 
 
 
426 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  31.64 
 
 
433 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  31.95 
 
 
478 aa  156  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  26.32 
 
 
427 aa  155  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  26.65 
 
 
434 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  28.16 
 
 
455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  28.16 
 
 
455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.87 
 
 
437 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  25.19 
 
 
443 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  25.74 
 
 
443 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  28.64 
 
 
474 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  26.92 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  28.79 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  27.19 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  26.57 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  25.39 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  25.63 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  25.51 
 
 
427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  27.44 
 
 
479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  28.05 
 
 
426 aa  145  1e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  28.48 
 
 
441 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  28.17 
 
 
443 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  27.25 
 
 
434 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  25.52 
 
 
444 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  27.25 
 
 
434 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  28.5 
 
 
448 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  26.72 
 
 
434 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  27.13 
 
 
473 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  27.37 
 
 
428 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  26.82 
 
 
461 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  28.75 
 
 
436 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  25.78 
 
 
432 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  26.23 
 
 
434 aa  143  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  28.39 
 
 
436 aa  143  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  28.39 
 
 
436 aa  143  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  25.22 
 
 
432 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  25.22 
 
 
432 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  23.82 
 
 
435 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  25.22 
 
 
432 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  25.22 
 
 
432 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  25.22 
 
 
432 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  29.13 
 
 
481 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  26.46 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>