More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0575 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  95.58 
 
 
362 aa  712    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  95.86 
 
 
362 aa  712    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  100 
 
 
362 aa  738    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  54.24 
 
 
363 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  51.11 
 
 
385 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  47.09 
 
 
386 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  49.12 
 
 
383 aa  349  4e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  46.69 
 
 
385 aa  343  4e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  46.96 
 
 
383 aa  342  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  46.52 
 
 
381 aa  338  8e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  46.54 
 
 
384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  46.26 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  46.26 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  47.25 
 
 
387 aa  335  9e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  46.13 
 
 
386 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  46.13 
 
 
382 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  45.68 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  46.67 
 
 
387 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  43.33 
 
 
384 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  43.33 
 
 
384 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  45.43 
 
 
388 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  44.57 
 
 
384 aa  322  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  45.8 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  46.13 
 
 
384 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  44.85 
 
 
383 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  44.35 
 
 
384 aa  317  3e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  43.21 
 
 
382 aa  316  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  44.75 
 
 
397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  43.92 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  44.06 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  44.48 
 
 
382 aa  312  5.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  43.5 
 
 
384 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  45.21 
 
 
400 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  42.02 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  43.73 
 
 
382 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  42.74 
 
 
380 aa  305  7e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  42.74 
 
 
380 aa  300  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  44.07 
 
 
360 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  42.5 
 
 
382 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  41.94 
 
 
382 aa  289  4e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  41.94 
 
 
382 aa  285  7e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  40.82 
 
 
379 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  41.9 
 
 
382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
382 aa  282  6.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  41.05 
 
 
387 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  38.5 
 
 
379 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  38.19 
 
 
360 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  37.95 
 
 
379 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  38.12 
 
 
380 aa  260  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  39.11 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  39.34 
 
 
406 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  37.67 
 
 
379 aa  257  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  38.8 
 
 
406 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  37.81 
 
 
406 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  38.63 
 
 
406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  40.61 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  39.34 
 
 
406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  41.27 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  40.06 
 
 
391 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  40.17 
 
 
391 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  40.5 
 
 
391 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  41.55 
 
 
401 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  37.25 
 
 
395 aa  249  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  36.67 
 
 
389 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  38.12 
 
 
422 aa  249  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  38.67 
 
 
401 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.5 
 
 
383 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  38.71 
 
 
394 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  39.34 
 
 
401 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  38.55 
 
 
391 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  37.84 
 
 
403 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  38.23 
 
 
414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  37.08 
 
 
379 aa  243  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  39.54 
 
 
415 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  35.83 
 
 
413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  37.36 
 
 
417 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  37.26 
 
 
400 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  40.72 
 
 
381 aa  236  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  37.5 
 
 
406 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  36.26 
 
 
417 aa  236  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  39.06 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  37.2 
 
 
402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  35.01 
 
 
381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  36.81 
 
 
398 aa  232  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  38.6 
 
 
398 aa  232  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.92 
 
 
380 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  36.59 
 
 
399 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  36.74 
 
 
391 aa  229  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  37.16 
 
 
415 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  35.39 
 
 
396 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  37.85 
 
 
396 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  36.57 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  38.1 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  36.19 
 
 
396 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  35.69 
 
 
391 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  36.26 
 
 
396 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  37.26 
 
 
395 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  36.99 
 
 
421 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  37.71 
 
 
395 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  36.75 
 
 
402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>