255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0569 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  100 
 
 
162 aa  322  1e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  88.27 
 
 
162 aa  286  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  89.31 
 
 
159 aa  285  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  47.33 
 
 
162 aa  142  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  48.37 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  44.08 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  45.03 
 
 
176 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  46.1 
 
 
152 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  45.64 
 
 
149 aa  121  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  48.41 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  50.81 
 
 
160 aa  117  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  48.3 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  48.12 
 
 
157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  45.95 
 
 
155 aa  113  8.999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  44.3 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  45.95 
 
 
156 aa  100  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  43.79 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  45.53 
 
 
184 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.4 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  43.62 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  48.8 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.94 
 
 
169 aa  87.8  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  44.44 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  44 
 
 
165 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  41.18 
 
 
168 aa  84  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.2 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  36.97 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  40.91 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  36.8 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  41.86 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  41.86 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  40.4 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  36 
 
 
156 aa  77  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  42.4 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  42.4 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  42.4 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  36.84 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  31.9 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  36.67 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  32.61 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  40.8 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  39.32 
 
 
241 aa  70.9  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  37.61 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  37.61 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  36.09 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  33.94 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  36.75 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  36.75 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  32.37 
 
 
247 aa  67.8  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  37.4 
 
 
245 aa  67.8  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  29.14 
 
 
220 aa  67.4  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  35.77 
 
 
279 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  32.33 
 
 
245 aa  67  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  36.75 
 
 
260 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  35.04 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  32.85 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  35.9 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  31.39 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  37.5 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  35.9 
 
 
289 aa  64.7  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  33.08 
 
 
245 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  35.38 
 
 
181 aa  63.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  30.83 
 
 
239 aa  63.9  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  28.16 
 
 
241 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  30.83 
 
 
245 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  30.83 
 
 
266 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  34.96 
 
 
243 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  35.04 
 
 
243 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  31.39 
 
 
280 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  30.83 
 
 
242 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  35.9 
 
 
270 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  32.33 
 
 
260 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  32.33 
 
 
241 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  32.48 
 
 
266 aa  62  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  32.43 
 
 
313 aa  62.4  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  28.06 
 
 
229 aa  62.4  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  32.59 
 
 
245 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  35.14 
 
 
171 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  35.94 
 
 
166 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  37.84 
 
 
275 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  36.13 
 
 
255 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  31.39 
 
 
332 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  29.66 
 
 
217 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  34.45 
 
 
225 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  26.62 
 
 
242 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  32.12 
 
 
248 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  29.93 
 
 
239 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  33.08 
 
 
264 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  31.62 
 
 
243 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  34.96 
 
 
263 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2422  hypothetical protein  33.08 
 
 
241 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>