More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0542 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
82 aa  167  5e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  96.34 
 
 
82 aa  165  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  95.12 
 
 
82 aa  164  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  51.28 
 
 
139 aa  98.6  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  48.75 
 
 
93 aa  97.8  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  50 
 
 
96 aa  97.1  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  48.75 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  46.34 
 
 
93 aa  94.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 
81 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 
90 aa  94  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 
81 aa  94  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 
90 aa  93.6  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  59.21 
 
 
95 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  43.9 
 
 
95 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  48.05 
 
 
88 aa  92.8  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 
119 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  50.62 
 
 
85 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 
91 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  56 
 
 
81 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  42.68 
 
 
191 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 
81 aa  90.5  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 
81 aa  90.5  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  51.28 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  46.34 
 
 
89 aa  90.5  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  57.33 
 
 
81 aa  90.1  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 
119 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 
88 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  47.62 
 
 
122 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  53.33 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 
88 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  48.75 
 
 
82 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  54.55 
 
 
81 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 
192 aa  88.6  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 
90 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
87 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  50 
 
 
201 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 
86 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  48.1 
 
 
81 aa  87.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
122 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 
88 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4205  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 
123 aa  87  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.847506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  46.84 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  46.25 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4075  30S ribosomal protein S16  45.68 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  45.45 
 
 
204 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 
195 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  46.75 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  50 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
145 aa  85.5  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  45.68 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 
82 aa  84.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  48.19 
 
 
185 aa  84.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  43.21 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  44.87 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  45 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  45.57 
 
 
82 aa  84  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  40.74 
 
 
134 aa  84  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0881  ribosomal protein S16  53.95 
 
 
81 aa  84  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000838528  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  43.04 
 
 
92 aa  84  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 
95 aa  84  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  52.63 
 
 
80 aa  84  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  44.05 
 
 
124 aa  83.6  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>