More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0488 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  97.78 
 
 		 406 aa  822    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  97.04 
 
 		 406 aa  815    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 406 aa  837    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  64.27 
 
 		 403 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  64.25 
 
 		 403 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  65.66 
 
 		 397 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 		 395 aa  556  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  65.98 
 
 		 396 aa  555  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  65.38 
 
 		 396 aa  548  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  68.48 
 
 		 391 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  68.48 
 
 		 391 aa  550  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  62.16 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  64.27 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  64.62 
 
 		 396 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  63.75 
 
 		 405 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  63.33 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  65.49 
 
 		 402 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  62.6 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  64.62 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 		 399 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 		 399 aa  532  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  63 
 
 		 405 aa  534  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  63.5 
 
 		 395 aa  533  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 399 aa  531  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  64.19 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  63.5 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 399 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 399 aa  529  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  63.59 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  62.5 
 
 		 396 aa  530  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  63.68 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 		 395 aa  522  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  63 
 
 		 414 aa  521  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  62.72 
 
 		 395 aa  522  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  61.36 
 
 		 397 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 		 393 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  62.22 
 
 		 399 aa  511  1e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  59.6 
 
 		 402 aa  511  1e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  59.49 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  61.32 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 		 399 aa  501  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  60.61 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  60.96 
 
 		 401 aa  499  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  57.4 
 
 		 402 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  60.31 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  59.85 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  61.44 
 
 		 393 aa  484  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  59.05 
 
 		 408 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  57.58 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  58.72 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  57.58 
 
 		 389 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1065  S-adenosylmethionine synthetase  59.64 
 
 		 397 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  58.16 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  57.58 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  57.33 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  57.33 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  57.33 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  60.1 
 
 		 391 aa  473  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15650  methionine adenosyltransferase  57.58 
 
 		 400 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  58.73 
 
 		 396 aa  471  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4357  S-adenosylmethionine synthetase  60.3 
 
 		 410 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.808224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 		 383 aa  471  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  58.91 
 
 		 390 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  58.38 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  56.96 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27040  methionine adenosyltransferase  59.54 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593252  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 		 383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2989  Methionine adenosyltransferase  59.49 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  57.22 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  57.22 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  56.96 
 
 		 384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 		 383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  60.36 
 
 		 391 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  57.22 
 
 		 384 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  56.81 
 
 		 383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  57.22 
 
 		 384 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4159  S-adenosylmethionine synthetase  58.52 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0297831  normal  0.258747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  56.81 
 
 		 383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  57.07 
 
 		 383 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  58.87 
 
 		 388 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  58.61 
 
 		 382 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4132  S-adenosylmethionine synthetase  53.9 
 
 		 421 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000371992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  56.96 
 
 		 384 aa  464  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  56.01 
 
 		 381 aa  464  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  56.96 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  57.22 
 
 		 384 aa  468  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0177  S-adenosylmethionine synthetase  59.43 
 
 		 389 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.225729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  57.18 
 
 		 384 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  56.96 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2256  S-adenosylmethionine synthetase  59.59 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0616987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0875  S-adenosylmethionine synthetase  56.41 
 
 		 384 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  56.96 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>