More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0486 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  89.81 
 
 
475 aa  760    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  92.42 
 
 
409 aa  778    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  100 
 
 
414 aa  848    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  50.25 
 
 
474 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  47.78 
 
 
471 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  40.34 
 
 
468 aa  322  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.65 
 
 
469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  40.1 
 
 
469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  38.65 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.9 
 
 
469 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.37 
 
 
469 aa  299  7e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.89 
 
 
469 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  39.08 
 
 
488 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  40.39 
 
 
463 aa  289  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  37.84 
 
 
471 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  36.86 
 
 
474 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  36.1 
 
 
486 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  36.65 
 
 
458 aa  266  5e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  36.08 
 
 
467 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.83 
 
 
474 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  36.17 
 
 
470 aa  263  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  35.04 
 
 
457 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.34 
 
 
474 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.52 
 
 
463 aa  254  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  35.7 
 
 
470 aa  252  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.54 
 
 
466 aa  252  9.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.59 
 
 
472 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.85 
 
 
470 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.56 
 
 
470 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  33.98 
 
 
467 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  36.3 
 
 
470 aa  247  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.12 
 
 
472 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  35.54 
 
 
475 aa  245  9e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.78 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  34.45 
 
 
479 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.74 
 
 
475 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  33.74 
 
 
473 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  35.61 
 
 
460 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.37 
 
 
460 aa  240  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  34.43 
 
 
474 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  34.85 
 
 
470 aa  239  8e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  35.71 
 
 
472 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  35.38 
 
 
480 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.38 
 
 
480 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  34.57 
 
 
490 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  33.09 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.07 
 
 
475 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  34.14 
 
 
460 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  32.76 
 
 
484 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  32.43 
 
 
460 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  33.82 
 
 
472 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  33.66 
 
 
460 aa  225  9e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.66 
 
 
472 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  33.17 
 
 
460 aa  223  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  36.1 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.29 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  31.43 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.5 
 
 
467 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.49 
 
 
487 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  31.43 
 
 
486 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  32.71 
 
 
482 aa  219  8.999999999999998e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  32.67 
 
 
485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  34.24 
 
 
733 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.01 
 
 
464 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.58 
 
 
487 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  35.11 
 
 
470 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  32.93 
 
 
478 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  32.04 
 
 
467 aa  210  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  30.62 
 
 
484 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.28 
 
 
473 aa  209  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  30.92 
 
 
473 aa  209  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  31 
 
 
484 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  33.41 
 
 
460 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  33.02 
 
 
484 aa  206  8e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  30.5 
 
 
484 aa  206  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  30.1 
 
 
501 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  31.35 
 
 
486 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  34.66 
 
 
487 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  30.91 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  30.34 
 
 
468 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  34.09 
 
 
452 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  29.8 
 
 
465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  31.3 
 
 
480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1298  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  29.82 
 
 
547 aa  170  4e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000236068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  32.32 
 
 
458 aa  159  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  31.41 
 
 
448 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0958  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.44 
 
 
574 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  29.88 
 
 
551 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.56 
 
 
585 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.74 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  31.33 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2334  Glucose-1,6-bisphosphate synthase  30.16 
 
 
577 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262197  normal  0.232256 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  30.3 
 
 
478 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  27.44 
 
 
458 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.57 
 
 
576 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  27.17 
 
 
549 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.88 
 
 
452 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  26.9 
 
 
549 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1330  phosphoglucomutase  28.77 
 
 
546 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66611  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1187  phosphoglucomutase  27 
 
 
548 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0977339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>