More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0462 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  100 
 
 		 103 aa  209  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  100 
 
 		 103 aa  209  7e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0485  50S ribosomal protein L24  98.06 
 
 		 103 aa  207  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0200384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 109 aa  130  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 107 aa  123  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 104 aa  120  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3317  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0944  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 105 aa  120  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 106 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 		 107 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 106 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4015  50S ribosomal protein L24  49.54 
 
 		 110 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0135425  hitchhiker  0.0000188954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1174  50S ribosomal protein L24  49.54 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.228607  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3013  50S ribosomal protein L24  48.62 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0278208  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0719  50S ribosomal protein L24  55.45 
 
 		 108 aa  114  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.172071  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 106 aa  114  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1077  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 109 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00115377  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 107 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2846  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0782978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0637  50S ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169052  hitchhiker  0.0000000115674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0226  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000370602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2322  ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000374748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0769  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000440948  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0671  50S ribosomal protein L24  51.89 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.367854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2703  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  48.11 
 
 		 110 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2388  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0205  LSU ribosomal protein L24P  47.96 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0945918  normal  0.325859 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0317  50S ribosomal protein L24P  45.95 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23360  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000132884  hitchhiker  0.000000126153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1357  50S ribosomal protein L24  50.51 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00374615  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 106 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2914  50S ribosomal protein L24  43.81 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  48.04 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  53.54 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2608  50S ribosomal protein L24  44.76 
 
 		 109 aa  97.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000338096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  46.94 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0338  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.530632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0508  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.000000000313767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  46.53 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0469  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 101 aa  94.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0691  50S ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 106 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  46.08 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1407  ribosomal protein L24  44 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  45.1 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>