More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0448 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0448  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  321  3e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307427  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_414  ribosomal protein S7  99.36 
 
 
156 aa  319  8e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000054715  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0471  30S ribosomal protein S7  98.72 
 
 
156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000140142  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  59.87 
 
 
157 aa  210  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  57.05 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  194  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  193  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  193  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  192  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3029  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
157 aa  191  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00356201  hitchhiker  0.0000198077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  191  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  191  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  189  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  189  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  188  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  188  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  187  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  187  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  187  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  187  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1188  ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  187  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000113483  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  186  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  186  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  186  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 
156 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  185  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 
155 aa  185  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1289  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  185  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00393219  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  185  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  184  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1602  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.630942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  184  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17011  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
155 aa  185  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  184  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  55.13 
 
 
156 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 
156 aa  184  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 
156 aa  184  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  184  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 
156 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  184  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  184  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  184  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  184  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1357  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  184  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216177  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 
156 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17131  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  184  6e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  51.92 
 
 
156 aa  184  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16901  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  183  7e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  183  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  183  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0660  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3758  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000681403  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  54.78 
 
 
157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  52.56 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0982  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695424  normal  0.0667494 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0493  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  53.21 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  53.85 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  54.49 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4650  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000326428  normal  0.0163007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3815  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00401885  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3752  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00237003  normal  0.0489847 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3920  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000046544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  51.28 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  52.6 
 
 
155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3644  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1189  30S ribosomal protein S7  53.25 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109999  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  54.49 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>