34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0371 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0371  endonuclease IV  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000053245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0392  AP endonuclease  93.48 
 
 		 276 aa  541  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000214103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_334  hypothetical protein  92.8 
 
 		 250 aa  483  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000260704  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2015  endonuclease IV  47.99 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  48.7 
 
 		 279 aa  265  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3723  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.35 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.761963  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  46.13 
 
 		 291 aa  255  6e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0994  xylose isomerase domain-containing protein  44.24 
 
 		 273 aa  235  7e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.148425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0951  xylose isomerase domain-containing protein  43.17 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1729  endonuclease IV  42.81 
 
 		 273 aa  228  6e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1039  xylose isomerase domain-containing protein  41.82 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0978  xylose isomerase domain-containing protein  41.73 
 
 		 273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.993013  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1335  AP endonuclease  42.45 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000125681  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1146  AP endonuclease  42.45 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000018522  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1641  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  41.79 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0144045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0729  endonuclease IV  32.97 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.769664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1518  xylose isomerase domain-containing protein  32.94 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.18 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0997  xylose isomerase domain-containing protein  31.88 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.596977  normal  0.586532 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0510  xylose isomerase domain-containing protein  32.35 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0284468 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1689  xylose isomerase domain-containing protein  31.87 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000000547831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1593  xylose isomerase domain-containing protein  31.62 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0485  xylose isomerase domain-containing protein  30.4 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0271808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1925  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  33.07 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0729922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1699  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.13 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1781  endonuclease IV  31.14 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000369589 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1981  xylose isomerase domain-containing protein  31.64 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000324599  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2669  xylose isomerase-like TIM barrel  30.64 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0145308  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0637  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.92 
 
 		 334 aa  91.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  24.07 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  23.81 
 
 		 298 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1331  apurinic endonuclease Apn1  25.29 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464999 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  32.94 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  22.38 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>