More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0323 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 175 aa  361  4e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  96 
 
 		 175 aa  351  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  95.43 
 
 		 175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 		 152 aa  177  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  52.7 
 
 		 151 aa  168  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 158 aa  165  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  47.06 
 
 		 153 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  49.37 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  50.34 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  50.31 
 
 		 153 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  49.06 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  44.38 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 154 aa  155  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  49.38 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 150 aa  153  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  52.9 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 150 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 153 aa  151  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  47.37 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 150 aa  148  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 163 aa  147  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 150 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  43.05 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 154 aa  147  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 162 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  44.08 
 
 		 155 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  43.84 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 153 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  45.7 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4956  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 150 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 156 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 151 aa  142  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 		 148 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  46.43 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  141  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  141  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  51.09 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  51.09 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  51.09 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  51.09 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  51.09 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0296  transcriptional regulator NrdR  54.74 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0472  transcriptional regulator NrdR  54.74 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.687081  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>