35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0212 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  87.71 
 
 
727 aa  1320    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  100 
 
 
731 aa  1502    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0321  hypothetical protein  37.47 
 
 
444 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2843  hypothetical protein  31.4 
 
 
575 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.6316  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1658  hypothetical protein  29.9 
 
 
694 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.261922  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5286  hypothetical protein  28.1 
 
 
971 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.55512  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2115  hypothetical protein  26.54 
 
 
1009 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2159  hypothetical protein  26.54 
 
 
1009 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135027  normal  0.649366 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2574  hypothetical protein  36.64 
 
 
426 aa  66.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0044  hypothetical protein  29.95 
 
 
967 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  35.62 
 
 
732 aa  60.8  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5619  hypothetical protein  28.65 
 
 
1003 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  26.16 
 
 
848 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1066  hypothetical protein  33.09 
 
 
1015 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619549  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  30.12 
 
 
701 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  26.16 
 
 
746 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2179  hypothetical protein  25.74 
 
 
1010 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019283 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0078  hypothetical protein  26.54 
 
 
962 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.253673 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0011  hypothetical protein  25.68 
 
 
1227 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0281  hypothetical protein  26.63 
 
 
1065 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0021  hypothetical protein  29.59 
 
 
234 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5420  hypothetical protein  33.64 
 
 
1170 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4775  hypothetical protein  26.34 
 
 
1034 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28900  hypothetical protein  27.31 
 
 
889 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2260  DNA primase-like protein  25.23 
 
 
922 aa  52.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0358  TOPRIM  26.86 
 
 
328 aa  50.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000814037  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1000  hypothetical protein  25.88 
 
 
430 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5473  hypothetical protein  26.88 
 
 
1114 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467574 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2139  ATPase-like protein  30.16 
 
 
642 aa  49.7  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.51863 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4396  hypothetical protein  25.52 
 
 
1050 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.360797 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5632  hypothetical protein  27.42 
 
 
1138 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000206849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12671  phiRv2 prophage protein  30.4 
 
 
475 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00480822  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1772  hypothetical protein  22.92 
 
 
1039 aa  47.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0362  hypothetical protein  23.61 
 
 
518 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0693  zinc finger CHC2-family protein  30.81 
 
 
407 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.473403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>