More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0142 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
404 aa  818    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  76.24 
 
 
404 aa  616  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
419 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
419 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
426 aa  123  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
425 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
453 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.14 
 
 
443 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.14 
 
 
443 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.14 
 
 
499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.14 
 
 
495 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 
443 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 
443 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 
498 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  28.57 
 
 
428 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  37.67 
 
 
386 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  33.63 
 
 
401 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.81 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
426 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.77 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
385 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
536 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  26.07 
 
 
395 aa  110  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.14 
 
 
435 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
423 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
414 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
427 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
409 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
422 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  31.94 
 
 
426 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.06 
 
 
443 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
399 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
385 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
388 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  22.88 
 
 
392 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  27.65 
 
 
402 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  29.3 
 
 
426 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  35.84 
 
 
395 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
397 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
448 aa  106  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
378 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
477 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.74 
 
 
399 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
438 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 
413 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
439 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 
827 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  38.1 
 
 
395 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
439 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 
672 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  32.73 
 
 
399 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
439 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
424 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
434 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.48 
 
 
396 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
362 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5198  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
426 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.603506  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
412 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  29.59 
 
 
382 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
396 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  29.59 
 
 
382 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
374 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
412 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 
394 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
371 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
410 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
386 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
409 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
399 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
387 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
360 aa  100  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
379 aa  100  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  28.04 
 
 
745 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 
384 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
417 aa  99.8  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
415 aa  99.8  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 
402 aa  99.8  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
387 aa  99.8  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  26.52 
 
 
418 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  26.15 
 
 
438 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
390 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  30.71 
 
 
404 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
398 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 
395 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  33.05 
 
 
396 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  29.3 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  27.61 
 
 
803 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
384 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.23 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
482 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
367 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>