64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0105 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  72.73 
 
 		 572 aa  279  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  51.28 
 
 		 245 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  50.86 
 
 		 248 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  48.71 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  48.71 
 
 		 242 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  46.98 
 
 		 242 aa  218  8.999999999999998e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  47.06 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  45.8 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  32.74 
 
 		 223 aa  132  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  34.91 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  37.02 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  33.33 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  30.84 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  30.84 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  31.49 
 
 		 226 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  28.1 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  29.06 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  27.75 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  30.56 
 
 		 244 aa  95.9  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  28.7 
 
 		 223 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  26.79 
 
 		 222 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  30.43 
 
 		 213 aa  95.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  31.84 
 
 		 238 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  32.04 
 
 		 226 aa  90.5  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30 
 
 		 196 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  29.11 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  26.92 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  30.3 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  27.7 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  24.14 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  27.09 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  25.75 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  26.85 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  26.79 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  29.11 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  26.52 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  25.45 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  23.98 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.4 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  28 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  28 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  29.25 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  25.71 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  26.24 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  26.05 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  24.89 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  27 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  26.07 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  26.19 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  26.89 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  25.36 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  27.4 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  26.5 
 
 		 222 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  26.24 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1999  hypothetical protein  42.62 
 
 		 156 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  26.24 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  22.22 
 
 		 652 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  25.82 
 
 		 218 aa  49.7  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  24.75 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6853  predicted protein  28.45 
 
 		 215 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.077341  normal  0.470395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  23.42 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  23.23 
 
 		 218 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  26.85 
 
 		 669 aa  43.1  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>