57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0096 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0096  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  530  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  98.8 
 
 		 548 aa  501  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  70.24 
 
 		 542 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  67.7 
 
 		 554 aa  363  1e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  42.5 
 
 		 510 aa  181  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  37.82 
 
 		 517 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  36.82 
 
 		 563 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  29.86 
 
 		 547 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  29.09 
 
 		 590 aa  98.6  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  31.39 
 
 		 518 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  28.69 
 
 		 551 aa  95.5  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25 
 
 		 561 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  28.32 
 
 		 561 aa  92.4  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.3 
 
 		 540 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  30.09 
 
 		 509 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  26.73 
 
 		 565 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0630  resolvase  26.46 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  32.88 
 
 		 579 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  27.5 
 
 		 537 aa  79.7  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  27.03 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3120  recombinase  31.53 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.964732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  33.12 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  26.92 
 
 		 613 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  25.49 
 
 		 506 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.17 
 
 		 521 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  29.45 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  22.08 
 
 		 665 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  26.58 
 
 		 522 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.05 
 
 		 546 aa  52.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.76 
 
 		 496 aa  52.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  24.23 
 
 		 421 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  27.49 
 
 		 476 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  36.11 
 
 		 534 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  34.72 
 
 		 534 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  22.73 
 
 		 542 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  24.88 
 
 		 564 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  22.73 
 
 		 542 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  22.73 
 
 		 542 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  25.71 
 
 		 542 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 		 504 aa  49.3  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1010  resolvase-like protein  28.21 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.204913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.33 
 
 		 515 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 534 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  30.28 
 
 		 494 aa  46.6  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2577  Resolvase domain protein  26.21 
 
 		 603 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.551292 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.48 
 
 		 498 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  19.82 
 
 		 541 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  27.74 
 
 		 562 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  26.83 
 
 		 415 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  22.86 
 
 		 525 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  24.23 
 
 		 523 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0913  resolvase domain-containing protein  20.8 
 
 		 554 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.955385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>