More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0092 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  427  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  41.63 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  50 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0029  Cro/CI family transcriptional regulator  50 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  30.85 
 
 		 92 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  35.14 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0149  molybdate-binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 349 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0290887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  33.78 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  33.78 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  31.73 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  38.81 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  38.81 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  38.81 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  38.81 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  38.81 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  30.93 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  37.5 
 
 		 62 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 142 aa  53.9  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3732  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 63 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268378  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0397  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000557711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0407  helix-turn-helix domain-containing protein  48.21 
 
 		 67 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000097753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 505 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 383 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 94 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  27.63 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 63 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 134 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 111 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  24.86 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  27.01 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  38.33 
 
 		 67 aa  52.8  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 63 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 180 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 180 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  40 
 
 		 328 aa  52  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 67 aa  52  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000253714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 135 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 64 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  25.76 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  25.76 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  25.76 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0815  Cro/CI family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 71 aa  51.6  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1025  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 68 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3903  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 64 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.009018  normal  0.0135287 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  40.98 
 
 		 352 aa  51.6  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 73 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  26.63 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 64 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  37.29 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 73 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  27.01 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 66 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 73 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  30.77 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0777  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 83 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000109093  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 107 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  36.9 
 
 		 368 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  44.83 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2103  XRE family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 528 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 68 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 65 aa  49.7  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 75 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 118 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4511  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 64 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11449  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  35.62 
 
 		 75 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  35.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 89 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  35.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  39.66 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  40.35 
 
 		 68 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  35 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  40.35 
 
 		 70 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 93 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0313  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 66 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.834607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 64 aa  48.5  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  30.84 
 
 		 321 aa  48.5  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  39.29 
 
 		 377 aa  48.5  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>