13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0084 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  799    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1041  hypothetical protein  43.68 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1477  hypothetical protein  42.52 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.192207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2650  replication initiation factor  27.22 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3699  hypothetical protein  28.62 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3067  replication initiation factor  26.72 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0900674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0100  hypothetical protein  27.98 
 
 		 368 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2276  replication initiation factor  26.49 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00843988  hitchhiker  0.00603168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1039  hypothetical protein  28.07 
 
 		 468 aa  93.2  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0392  hypothetical protein  24.18 
 
 		 382 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.375122 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3581  hypothetical protein  24.14 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106267  normal  0.283892 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1569  hypothetical protein  21.51 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.409726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2011  hypothetical protein  26.92 
 
 		 431 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>