65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0074 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  43.94 
 
 		 868 aa  767    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  43.94 
 
 		 868 aa  767    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  43.94 
 
 		 868 aa  767    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  100 
 
 		 867 aa  1818    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0075  hypothetical protein  37.75 
 
 		 397 aa  267  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.5 
 
 		 1002 aa  225  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.74 
 
 		 1006 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0501  hypothetical protein  25.44 
 
 		 647 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000301954  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  38.06 
 
 		 815 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  39.27 
 
 		 732 aa  168  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  37.22 
 
 		 701 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  40.6 
 
 		 880 aa  161  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  40.77 
 
 		 725 aa  157  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  42.37 
 
 		 590 aa  147  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  37.26 
 
 		 718 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  34.43 
 
 		 738 aa  108  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1776 aa  108  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  29.84 
 
 		 756 aa  95.5  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  32.3 
 
 		 278 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  29.74 
 
 		 437 aa  90.9  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  41.67 
 
 		 147 aa  76.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  29.37 
 
 		 895 aa  72.8  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  27.92 
 
 		 741 aa  71.2  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  27.8 
 
 		 277 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  38.2 
 
 		 136 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  30.88 
 
 		 798 aa  65.1  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  47.76 
 
 		 127 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  48.21 
 
 		 312 aa  63.2  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  46.43 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  28.34 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  47.54 
 
 		 141 aa  58.9  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  43.86 
 
 		 296 aa  57  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  42.86 
 
 		 759 aa  55.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  60.53 
 
 		 696 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  29.41 
 
 		 979 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  53.66 
 
 		 293 aa  51.6  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  42.86 
 
 		 283 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  27.07 
 
 		 731 aa  49.3  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  37.93 
 
 		 280 aa  49.7  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  31 
 
 		 614 aa  49.3  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  31 
 
 		 605 aa  49.3  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  25.76 
 
 		 682 aa  48.9  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  24.9 
 
 		 684 aa  48.1  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  31 
 
 		 605 aa  47.8  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  45.1 
 
 		 595 aa  47  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  26.98 
 
 		 759 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  32.59 
 
 		 930 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  38.78 
 
 		 606 aa  47  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  28.57 
 
 		 712 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  44.68 
 
 		 554 aa  45.8  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  43.1 
 
 		 609 aa  45.8  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  30.39 
 
 		 656 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1709  zinc finger, CHC2-family protein  29.31 
 
 		 350 aa  45.8  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  27.27 
 
 		 571 aa  45.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  25.28 
 
 		 654 aa  45.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  27.27 
 
 		 720 aa  45.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  43.1 
 
 		 588 aa  45.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  43.1 
 
 		 586 aa  45.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  28.57 
 
 		 712 aa  45.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  28.57 
 
 		 712 aa  45.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  28.03 
 
 		 584 aa  45.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2245  hypothetical protein  24.58 
 
 		 631 aa  45.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.67793  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  25.96 
 
 		 765 aa  44.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  30.85 
 
 		 535 aa  44.3  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  44.68 
 
 		 572 aa  44.3  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>