More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0051 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  45.26 
 
 
857 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  45.26 
 
 
857 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  49.33 
 
 
870 aa  805    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  97.81 
 
 
824 aa  1577    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  51.35 
 
 
812 aa  835    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  47.63 
 
 
865 aa  743    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3316  chaperone-associated ATPase, putative  47.68 
 
 
940 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  56.75 
 
 
817 aa  942    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  57.81 
 
 
811 aa  951    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  46 
 
 
857 aa  731    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  57.81 
 
 
811 aa  951    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  57.81 
 
 
811 aa  951    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  57.69 
 
 
811 aa  949    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.76 
 
 
865 aa  725    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  57.39 
 
 
830 aa  934    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  55.01 
 
 
855 aa  939    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  57.93 
 
 
823 aa  960    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  45.28 
 
 
872 aa  749    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  55.62 
 
 
814 aa  906    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  45.76 
 
 
865 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6998  putative ClpA/B protease, ATPase subunit  48.52 
 
 
949 aa  742    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  48.57 
 
 
847 aa  797    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  44.19 
 
 
862 aa  728    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  56.54 
 
 
843 aa  947    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1484  ATPase  48.13 
 
 
863 aa  748    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  56.33 
 
 
846 aa  949    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1661  ATPase  46.26 
 
 
863 aa  728    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3413  ATPase  46.7 
 
 
949 aa  744    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0114965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  57.81 
 
 
811 aa  951    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  54.76 
 
 
842 aa  936    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  58.4 
 
 
824 aa  965    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  44.28 
 
 
883 aa  735    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  45.19 
 
 
869 aa  731    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  58.33 
 
 
840 aa  928    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.28 
 
 
865 aa  725    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  48.51 
 
 
870 aa  750    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  57.64 
 
 
834 aa  941    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  45.75 
 
 
859 aa  729    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1170  ATPase AAA-2  47.74 
 
 
949 aa  760    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.501064  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  46.4 
 
 
861 aa  743    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1887  putative ATP-dependent Clp protease, ATP- binding subunit  46.91 
 
 
961 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135075  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2861  ATPase AAA-2  45.89 
 
 
862 aa  726    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.133285  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  46.45 
 
 
860 aa  726    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0841  ATPase AAA-2  44.99 
 
 
865 aa  724    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  49.49 
 
 
818 aa  756    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  47.13 
 
 
878 aa  751    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  45.64 
 
 
862 aa  733    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2391  ATPase AAA-2  45.32 
 
 
859 aa  723    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1406  ATPase AAA-2  48.28 
 
 
946 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  57.05 
 
 
847 aa  909    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  50.69 
 
 
837 aa  762    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  51.31 
 
 
886 aa  761    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  55.73 
 
 
834 aa  934    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  45.1 
 
 
858 aa  723    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  47.55 
 
 
891 aa  752    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  48.21 
 
 
848 aa  793    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  50.92 
 
 
814 aa  818    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  50.92 
 
 
814 aa  816    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  45.49 
 
 
856 aa  727    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  43.92 
 
 
870 aa  723    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  57.23 
 
 
825 aa  966    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  54.98 
 
 
825 aa  915    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  45.65 
 
 
857 aa  730    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  45.65 
 
 
857 aa  730    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  45.62 
 
 
864 aa  736    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0669  ATPase  45.91 
 
 
865 aa  724    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  55.9 
 
 
828 aa  937    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  45.72 
 
 
868 aa  725    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5668  ATPase  48.12 
 
 
953 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2575  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06000  putative ClpA/B protease ATP binding subunit  48.87 
 
 
850 aa  744    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0160864 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  48.66 
 
 
823 aa  798    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  48.58 
 
 
838 aa  769    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  49.26 
 
 
826 aa  777    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  55.93 
 
 
830 aa  911    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6423  ATPase  48.28 
 
 
946 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.707526  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3169  ATPase  45.65 
 
 
857 aa  730    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00027679  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  57.62 
 
 
839 aa  941    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1737  ATPase  45.42 
 
 
873 aa  743    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  49.34 
 
 
854 aa  801    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  56.44 
 
 
861 aa  912    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2603  clpB protein  46.34 
 
 
857 aa  736    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0399134  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  57.05 
 
 
847 aa  909    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3263  chaperone ClpB  46.18 
 
 
857 aa  742    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  57.3 
 
 
847 aa  929    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3393  ATPase  47.07 
 
 
949 aa  753    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3198  ATPase  45.74 
 
 
867 aa  725    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1867  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.76 
 
 
865 aa  725    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60175  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2232  ATPase  44.28 
 
 
870 aa  724    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  54.67 
 
 
842 aa  938    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  54.95 
 
 
843 aa  942    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  55.13 
 
 
855 aa  942    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  55.09 
 
 
859 aa  940    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0030  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.76 
 
 
865 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  56.54 
 
 
818 aa  962    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1019  ATPase  45.65 
 
 
857 aa  727    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00163715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2223  ATPase AAA-2  45.64 
 
 
865 aa  724    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2261  clpB protein  45.76 
 
 
865 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  57.05 
 
 
847 aa  926    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1138  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  45.76 
 
 
865 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  54.61 
 
 
841 aa  934    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>