More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0029 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  93.17 
 
 		 454 aa  863    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  100 
 
 		 454 aa  913    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  94.93 
 
 		 454 aa  874    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  35.46 
 
 		 450 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  35.96 
 
 		 450 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  35.68 
 
 		 443 aa  262  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  32.82 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  33.04 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  33.84 
 
 		 450 aa  249  9e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  31.66 
 
 		 454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1970  potassium transporter peripheral membrane component  34.65 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.616677  normal  0.0915611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.58 
 
 		 449 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  33.62 
 
 		 458 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  32.4 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  33.76 
 
 		 458 aa  238  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  33.62 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  33.76 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  33.19 
 
 		 457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  33.98 
 
 		 457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  32.97 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  32.97 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  30.15 
 
 		 449 aa  233  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  33.05 
 
 		 467 aa  233  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  33.48 
 
 		 457 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2455  potassium transporter peripheral membrane component  31.66 
 
 		 452 aa  227  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341783  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  31.83 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  32.69 
 
 		 459 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5096  TrkA-N domain protein  32.24 
 
 		 448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  31.69 
 
 		 445 aa  222  9e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  31.06 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  32.54 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  31.18 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  31.13 
 
 		 465 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  31.4 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  30.24 
 
 		 458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  30.24 
 
 		 458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  30.24 
 
 		 458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  31.83 
 
 		 457 aa  216  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  31.18 
 
 		 457 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  31.6 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  29.96 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  31.44 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  31.62 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  30.94 
 
 		 444 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  31.79 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  30.45 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0021  potassium transporter peripheral membrane component  31.7 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  30.04 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  31.96 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  29.81 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  29.59 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  30.24 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  30.41 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  29.46 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  29.46 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  29.46 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  29.46 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  29.46 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0032  potassium transporter peripheral membrane component  29.83 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0670474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0021  potassium transporter peripheral membrane component  30.64 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  28.41 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0028  potassium transporter peripheral membrane component  30.85 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.736909  normal  0.0141363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  31.07 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0028  potassium transporter peripheral membrane component  30.85 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000283519 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0029  potassium transporter peripheral membrane component  30.85 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.313972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  29.25 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3739  potassium transporter peripheral membrane component  29.83 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0024  potassium transporter peripheral membrane component  30.85 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  29.25 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  29.16 
 
 		 458 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0040  potassium transporter peripheral membrane component  29.85 
 
 		 469 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.165147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  28.82 
 
 		 458 aa  203  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  32.97 
 
 		 448 aa  202  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0029  potassium transporter peripheral membrane component  30.04 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0026  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570638  hitchhiker  0.00237688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0024  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.738729  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0032  potassium transporter peripheral membrane component  30.43 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21174  hitchhiker  0.00000689203 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0072  potassium transporter peripheral membrane component  30.85 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0021  potassium transporter peripheral membrane component  30.26 
 
 		 469 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  29.25 
 
 		 458 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  31.83 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  30.2 
 
 		 454 aa  200  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0014  TrkA domain-containing protein  31.05 
 
 		 457 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  30.15 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  29.46 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  30.31 
 
 		 477 aa  199  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  28.04 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0081  potassium transporter peripheral membrane component  28.82 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  31.9 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  30.04 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  31.18 
 
 		 457 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0544  potassium transporter peripheral membrane component  30.89 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.027133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>