More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0026 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  99.25 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  97.76 
 
 
134 aa  269  8.000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  56.15 
 
 
137 aa  157  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  49.25 
 
 
206 aa  137  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  47.73 
 
 
210 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  45.38 
 
 
224 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  47.86 
 
 
220 aa  120  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  41.04 
 
 
214 aa  120  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  48.72 
 
 
227 aa  120  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  45.38 
 
 
221 aa  120  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  46.15 
 
 
221 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  46.46 
 
 
223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  41.04 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  46.46 
 
 
224 aa  118  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  44.62 
 
 
264 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  45.6 
 
 
217 aa  117  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  47.86 
 
 
220 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  49.57 
 
 
220 aa  117  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  44.62 
 
 
221 aa  116  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  44.53 
 
 
221 aa  115  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  44.62 
 
 
221 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  41.22 
 
 
219 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  46.67 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  44.62 
 
 
223 aa  114  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  48.72 
 
 
221 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  43.85 
 
 
221 aa  114  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  43.85 
 
 
234 aa  114  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  46.09 
 
 
219 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  43.9 
 
 
222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  43.41 
 
 
219 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  45.24 
 
 
224 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  38.93 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  43.85 
 
 
236 aa  108  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  42.4 
 
 
216 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  44 
 
 
217 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  44 
 
 
217 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  44 
 
 
217 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  43.08 
 
 
242 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  44.64 
 
 
218 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  41.18 
 
 
214 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  38.17 
 
 
138 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  39.67 
 
 
219 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  42.02 
 
 
214 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  45.38 
 
 
222 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  42.4 
 
 
216 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  43.08 
 
 
243 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  41.91 
 
 
220 aa  97.1  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2911  TrkA-N domain protein  41.27 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0359474  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  40.94 
 
 
233 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  35.11 
 
 
226 aa  90.1  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  30.71 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  32.06 
 
 
225 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  32.81 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  31.54 
 
 
225 aa  80.5  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  36.57 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  37.86 
 
 
457 aa  77  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  36.57 
 
 
221 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0313  potassium transporter peripheral membrane component  40.4 
 
 
458 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.888467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  40.4 
 
 
458 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0612  potassium transporter peripheral membrane component  40.4 
 
 
458 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0369792  normal  0.0559785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  39.22 
 
 
458 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3721  potassium transporter peripheral membrane component  34.59 
 
 
458 aa  75.5  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455601  hitchhiker  0.00773793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03140  potassium transporter peripheral membrane component  34.59 
 
 
458 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.946548  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0424  TrkA-N domain protein  34.59 
 
 
458 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0424  potassium transporter peripheral membrane component  34.59 
 
 
458 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3483  potassium transporter peripheral membrane component  34.59 
 
 
458 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0624843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3585  potassium transporter peripheral membrane component  34.59 
 
 
458 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.931761  normal  0.13042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03091  hypothetical protein  34.59 
 
 
458 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4612  potassium transporter peripheral membrane component  34.59 
 
 
458 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00524775  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3772  potassium transporter peripheral membrane component  34.59 
 
 
458 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3674  potassium transporter peripheral membrane component  34.59 
 
 
458 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  35.07 
 
 
221 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  34.17 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3606  potassium transporter peripheral membrane component  33.83 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3713  potassium transporter peripheral membrane component  33.83 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.461523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3678  potassium transporter peripheral membrane component  33.83 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3776  potassium transporter peripheral membrane component  33.83 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3605  potassium transporter peripheral membrane component  33.83 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  29.85 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  34.35 
 
 
617 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  29.85 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.85 
 
 
221 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  35.07 
 
 
221 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3971  potassium transporter peripheral membrane component  38.38 
 
 
458 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0755481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3912  potassium transporter peripheral membrane component  34.34 
 
 
484 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3261  potassium transporter peripheral membrane component  34.34 
 
 
484 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.386779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3792  potassium transporter peripheral membrane component  38.38 
 
 
458 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1919  TrkA domain-containing protein  35.9 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0436  potassium transporter peripheral membrane component  36.36 
 
 
458 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  31.88 
 
 
457 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0020  potassium transporter peripheral membrane component  38.38 
 
 
459 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.688304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  35.35 
 
 
458 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  34.35 
 
 
626 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  28.89 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0017  potassium transporter peripheral membrane component  37.37 
 
 
458 aa  69.3  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  36.61 
 
 
469 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  33.04 
 
 
485 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  27.34 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>