21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0013 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0013  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  460  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0188958  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_13  hypothetical protein  89.61 
 
 		 233 aa  417  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0014  hypothetical protein  89.61 
 
 		 231 aa  417  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.151106  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0015  putative lipoprotein  24.78 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0890287  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0014  hypothetical protein  25.65 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000507536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_14  lipoprotein  26.52 
 
 		 294 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1809  hypothetical protein  27.07 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2828  hypothetical protein  26.11 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4258  hypothetical protein  24 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.175632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0743  Sodium:galactoside symporter  25.21 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  21.9 
 
 		 847 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  24.29 
 
 		 847 aa  55.1  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0197  hypothetical protein  26.53 
 
 		 244 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09553  hypothetical protein  22.49 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1497  hypothetical protein  21.74 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0893  hypothetical protein  22.32 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2367  hypothetical protein  22.48 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.166353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1592  hypothetical protein  21.3 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09548  hypothetical protein  23.05 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2419  hypothetical protein  19.3 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000101688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6213  putative lipoprotein  26.56 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>