More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0008 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0008  membrane protein  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_8  hypothetical protein  89 
 
 
212 aa  345  2e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0008  membrane protein  89.95 
 
 
208 aa  322  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.48 
 
 
208 aa  104  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0965  membrane protein  36.9 
 
 
210 aa  101  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000215591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_838  hypothetical protein  35.83 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000326909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0856  membrane protein  35.83 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000027794  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  38.37 
 
 
198 aa  95.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  38.37 
 
 
198 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  35.92 
 
 
200 aa  92.8  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  32.51 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.67 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  35.81 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  32.31 
 
 
217 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  33.33 
 
 
222 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  34.55 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  47.22 
 
 
198 aa  87.8  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  38.53 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1445  hypothetical protein  44.23 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000632214  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.26 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  36.71 
 
 
235 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0781  membrane protein  37.68 
 
 
209 aa  85.1  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000234105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  37.67 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  38.1 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  30.41 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  35.54 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1217  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.57 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  39.83 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.57 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1226  hypothetical protein  45.28 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3272  protein of unknown function DUF205  34.55 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2827  protein of unknown function DUF205  34.55 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  36.91 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.41 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  36.81 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.41 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  35.48 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  41.51 
 
 
195 aa  82  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.41 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.41 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.41 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.41 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  38.89 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.91 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  33.16 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.41 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.41 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.41 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.14 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0684  protein of unknown function DUF205  30.34 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  35.44 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0998  hypothetical protein  26.7 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  33.54 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1611  membrane protein  34.67 
 
 
233 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  30.37 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2184  protein of unknown function DUF205  34.82 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0014182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  29.76 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  32.28 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  33.54 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  35.86 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  35.86 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.1 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1357  membrane protein  38.39 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  32.7 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.23 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  39.17 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  39.17 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.48 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  33.54 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  31.65 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  36.14 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  39.17 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  31.75 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.14 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  31.09 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  31.09 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  37.82 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  35.62 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  29.79 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1493  hypothetical protein  32.67 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2907  membrane protein  33.12 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000899467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  34.44 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  43.27 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  30 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  30.73 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  29.69 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  28.5 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  28.5 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  37.04 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  41.35 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  29.57 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.57 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.54 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00023  32.02 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201169  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.93 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1758  hypothetical protein  34.9 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  34.13 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  37.84 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.34 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  32.62 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>