More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0002 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  93.16 
 
 
424 aa  776  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  92.22 
 
 
424 aa  770  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  100 
 
 
424 aa  857  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  44.55 
 
 
422 aa  310  3e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.84 
 
 
417 aa  305  1e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  44.6 
 
 
423 aa  303  3e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50.45 
 
 
354 aa  302  6e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.45 
 
 
354 aa  302  7e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.24 
 
 
463 aa  302  9e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.15 
 
 
354 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.12 
 
 
435 aa  300  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  44.57 
 
 
427 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.27765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.39 
 
 
464 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.47894e-05  hitchhiker  3.62877e-14 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.22 
 
 
426 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.64035e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  40.32 
 
 
500 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  42.26 
 
 
435 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.57 
 
 
429 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  48.35 
 
 
353 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.32 
 
 
482 aa  290  4e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.15993e-05  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.12 
 
 
454 aa  290  5e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  43.12 
 
 
457 aa  287  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  41.8 
 
 
435 aa  288  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  45.13 
 
 
432 aa  287  3e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  44.39 
 
 
428 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.45 
 
 
425 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.76 
 
 
439 aa  286  6e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  43.69 
 
 
439 aa  286  6e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.45 
 
 
437 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.27 
 
 
425 aa  285  1e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.78 
 
 
438 aa  284  2e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.77499e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  42.6 
 
 
430 aa  283  3e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  42.6 
 
 
430 aa  283  3e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  45.01 
 
 
423 aa  283  4e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.4 
 
 
464 aa  281  1e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  1.09453e-12 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.81 
 
 
346 aa  282  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  41.71 
 
 
430 aa  282  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  4.54316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  50.3 
 
 
329 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  49.85 
 
 
343 aa  279  8e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.42 
 
 
434 aa  278  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  41.57 
 
 
428 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  48 
 
 
366 aa  275  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.08 
 
 
505 aa  275  9e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  41.71 
 
 
428 aa  274  2e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  42.03 
 
 
428 aa  273  4e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  41.8 
 
 
428 aa  273  4e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  47.59 
 
 
424 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  41.57 
 
 
428 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  43.25 
 
 
428 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  41.57 
 
 
428 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  43.25 
 
 
428 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  40.7 
 
 
434 aa  270  3e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  41.57 
 
 
428 aa  270  3e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  49.55 
 
 
338 aa  270  3e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  41.57 
 
 
428 aa  270  3e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  41.57 
 
 
428 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.61 
 
 
463 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.09 
 
 
350 aa  270  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  40.75 
 
 
450 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  45.27 
 
 
345 aa  269  6e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  45.96 
 
 
366 aa  269  6e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  41.11 
 
 
428 aa  269  8e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  46.53 
 
 
338 aa  269  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  49.85 
 
 
366 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  47.69 
 
 
368 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  40.47 
 
 
439 aa  268  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  39.77 
 
 
516 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.44 
 
 
458 aa  266  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.62 
 
 
415 aa  266  6e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  9.3637e-06  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  46.59 
 
 
343 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  40.32 
 
 
427 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.15 
 
 
426 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.75 
 
 
327 aa  265  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.43 
 
 
344 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  46.53 
 
 
338 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.43 
 
 
344 aa  265  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.08 
 
 
426 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02391  GTPase ObgE  47.45 
 
 
329 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.13 
 
 
344 aa  264  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  47.59 
 
 
329 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.04 
 
 
452 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  46.99 
 
 
338 aa  263  5e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  46.53 
 
 
352 aa  263  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  46.06 
 
 
387 aa  263  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  46.92 
 
 
348 aa  262  7e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  41.97 
 
 
419 aa  262  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.15 
 
 
368 aa  262  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  43.65 
 
 
425 aa  262  9e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.57 
 
 
348 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  45.62 
 
 
338 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.32 
 
 
491 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.12 
 
 
342 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  47.59 
 
 
329 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  46.25 
 
 
350 aa  260  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03941  GTPase ObgE  49.24 
 
 
329 aa  259  5e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.937616 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  44.78 
 
 
353 aa  259  5e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  47.29 
 
 
329 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  47.29 
 
 
329 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  45.82 
 
 
346 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  44.57 
 
 
372 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  49.23 
 
 
345 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>