More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_R0008 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_R0040  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.443427  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0058  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.102192  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0008  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0057  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.926394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0063  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.809971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0026  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0532408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0033  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0029  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0022  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0012  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0077  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0084  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0022  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0006  tRNA-Ile  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293878 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0547  tRNA-Ile  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0002  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0021  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0055  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0078  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0005  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0019  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0045  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.165882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0063  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0043  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0053  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0030  tRNA-Ile  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA17  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA9  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0048  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.622626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0014    92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0032  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0042  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0054  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0052  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0058  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0064  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0019  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0064  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.17499  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0011  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0069  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0014  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0055  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0052  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.461525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0006  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0062  tRNA-Ile  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.648574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0071  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0053  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0080  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0041  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.018808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0050  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0020  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0060  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0014  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.712374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0043  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0027  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0020  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0033  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.715295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0041  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0014  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0028  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  hitchhiker  0.002006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0052  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.307306  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0043  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.333285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0022  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.983676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0012  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.430923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0028  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0035  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0067  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0634109  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0028  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0012  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181038  normal  0.23369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0035  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0007  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32375  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0022  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0036  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0042  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0021  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6014  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0064  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4324  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101134  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4348  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.265257  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4353  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6007  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.358731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0050  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303318 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0049  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.319822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0037  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0058  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0085  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0058  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0064  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0072  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.152177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0003  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00132267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0042  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0003  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0051  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0003  tRNA-Ile  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.784686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>