21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2324 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 561 aa  1156    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  46.99 
 
 		 555 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  43.76 
 
 		 554 aa  445  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  40.23 
 
 		 558 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  35.93 
 
 		 535 aa  336  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  30.58 
 
 		 552 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  25.49 
 
 		 614 aa  136  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  23.14 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  23.67 
 
 		 568 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  22.09 
 
 		 505 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  22.53 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  19.15 
 
 		 510 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.12 
 
 		 892 aa  50.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  32.18 
 
 		 437 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  25.7 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  21.07 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 888 aa  47  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  28.57 
 
 		 1275 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.91 
 
 		 895 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.17 
 
 		 895 aa  45.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  26.95 
 
 		 896 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>