More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2301 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 70 aa  146  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1442  50S ribosomal protein L31  76.12 
 
 		 71 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  72.46 
 
 		 69 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  70 
 
 		 71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  70.59 
 
 		 74 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  67.14 
 
 		 73 aa  100  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 69 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 68 aa  94  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  55.71 
 
 		 70 aa  93.6  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 69 aa  91.7  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 67 aa  91.3  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  57.14 
 
 		 72 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  56.34 
 
 		 74 aa  88.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 75 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 66 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 65 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 66 aa  87.4  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  52.86 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03821  50S ribosomal subunit protein L31  59.38 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4049  ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03770  hypothetical protein  59.38 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4082  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4378  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4168  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  52.86 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  57.14 
 
 		 76 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4419  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5394  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.948116  normal  0.943424 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4472  50S ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 70 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  52.86 
 
 		 74 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 66 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 73 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  55.38 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  53.52 
 
 		 74 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 73 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 69 aa  84.3  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  53.52 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  53.03 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4037  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  53.85 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  52.31 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 65 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  51.43 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  53.85 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  59.38 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  55.22 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  48.57 
 
 		 70 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  59.02 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  51.56 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  56.25 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3354  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  48.57 
 
 		 70 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  53.73 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4788  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 71 aa  80.1  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000702878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  50 
 
 		 71 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  48.57 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0118  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  53.73 
 
 		 72 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4098  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3811  50S ribosomal protein L31  50.77 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  47.14 
 
 		 71 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  52.24 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  54.29 
 
 		 69 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  48.57 
 
 		 70 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>