More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2274 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  723    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  77.01 
 
 
349 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.71 
 
 
349 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  74.14 
 
 
348 aa  541  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  72.14 
 
 
341 aa  508  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  69.82 
 
 
340 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  64.31 
 
 
339 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  63.42 
 
 
339 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  62.24 
 
 
339 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  64.01 
 
 
339 aa  421  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.71 
 
 
339 aa  417  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.71 
 
 
339 aa  417  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.36 
 
 
351 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.77 
 
 
339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.4 
 
 
333 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.49 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  58.56 
 
 
332 aa  388  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.19 
 
 
329 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.26 
 
 
336 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.68 
 
 
344 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1066  aspartate semialdehyde dehydrogenase  58.68 
 
 
335 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.058115  hitchhiker  0.00506315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.8 
 
 
340 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.69 
 
 
340 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.68 
 
 
340 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  56.08 
 
 
340 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.93 
 
 
344 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
344 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.04 
 
 
344 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.06 
 
 
340 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.4 
 
 
340 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.16 
 
 
344 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.49 
 
 
347 aa  371  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
344 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.06 
 
 
344 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  56.38 
 
 
340 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.85 
 
 
340 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.19 
 
 
344 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.19 
 
 
344 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.89 
 
 
329 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.91 
 
 
341 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.79 
 
 
343 aa  371  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.33 
 
 
340 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.19 
 
 
332 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.31 
 
 
341 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2701  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.97 
 
 
343 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.31 
 
 
335 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.9 
 
 
344 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.28 
 
 
344 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.3 
 
 
344 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.57 
 
 
344 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.92 
 
 
338 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.87 
 
 
344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 
338 aa  362  6e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.89 
 
 
340 aa  362  6e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.28 
 
 
344 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0670  aspartate semialdehyde dehydrogenase  53.31 
 
 
337 aa  362  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1376  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.19 
 
 
340 aa  361  8e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0300827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0034  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.19 
 
 
340 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 
344 aa  360  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.56 
 
 
359 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.68 
 
 
337 aa  360  2e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3240  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.29 
 
 
340 aa  360  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.59 
 
 
344 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0044  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.89 
 
 
340 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.72 
 
 
345 aa  359  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.79 
 
 
344 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.83 
 
 
358 aa  359  4e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000172647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  57.19 
 
 
339 aa  359  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  52.71 
 
 
338 aa  358  5e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0114  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.89 
 
 
340 aa  358  5e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0350  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.99 
 
 
334 aa  358  5e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.16 
 
 
344 aa  358  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.69 
 
 
344 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1715  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.49 
 
 
340 aa  358  9e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.79 
 
 
357 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.19 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04100  aspartate semialdehyde dehydrogenase  51.33 
 
 
346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.917016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
349 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.69 
 
 
344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.69 
 
 
344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
349 aa  355  5e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
349 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
348 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
348 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
348 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.16 
 
 
348 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.87 
 
 
348 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.87 
 
 
336 aa  354  1e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.52 
 
 
341 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.45 
 
 
347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  52.23 
 
 
338 aa  352  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.28 
 
 
337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3732  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.25 
 
 
336 aa  352  7e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357313  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
348 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0139  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.89 
 
 
330 aa  351  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.71 
 
 
339 aa  350  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.7 
 
 
358 aa  350  1e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000518903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>