More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2248 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  100 
 
 		 366 aa  730    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  70.84 
 
 		 366 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  74.64 
 
 		 366 aa  488  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  70.69 
 
 		 368 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  60.59 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  60.29 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.34 
 
 		 333 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  55.52 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  53.47 
 
 		 395 aa  302  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  51.32 
 
 		 408 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  51.32 
 
 		 408 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  51.03 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  50.58 
 
 		 341 aa  299  5e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 341 aa  298  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  53.78 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  50.73 
 
 		 408 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.54 
 
 		 426 aa  295  6e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.43 
 
 		 370 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  49.85 
 
 		 387 aa  294  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  52.05 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  50.88 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  50.71 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  47.35 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 326 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.12 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  50.43 
 
 		 406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 339 aa  288  7e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 339 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  47.22 
 
 		 407 aa  286  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  51.04 
 
 		 327 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  50.8 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  46.22 
 
 		 439 aa  285  5.999999999999999e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.98 
 
 		 370 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.27 
 
 		 417 aa  285  8e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.92 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  49.41 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  45.9 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 435 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  49.7 
 
 		 407 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  50.75 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  53.64 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  50.58 
 
 		 345 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  52.38 
 
 		 370 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.58 
 
 		 350 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  55.14 
 
 		 402 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.5 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 392 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  53.94 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  52.68 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  48.69 
 
 		 392 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 372 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.59 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  53.13 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 357 aa  279  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  50 
 
 		 361 aa  279  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  48.05 
 
 		 337 aa  279  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  49.27 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  53.58 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  45.48 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  51.8 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  50 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  48.98 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  49.27 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.01 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  52.38 
 
 		 373 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  47.63 
 
 		 424 aa  275  9e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 364 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  52.08 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  53.72 
 
 		 397 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  48.8 
 
 		 356 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  49.14 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  50.28 
 
 		 348 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  53.49 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.77 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  53.33 
 
 		 405 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.11 
 
 		 340 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 329 aa  272  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  47.84 
 
 		 357 aa  272  8.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  53 
 
 		 405 aa  271  9e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  49.42 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  50 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  47.56 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.41 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  50.44 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.97 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.29 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  46.24 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>