25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2231 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2231  hypothetical protein  100 
 
 		 702 aa  1450    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0202187  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2162  hypothetical protein  39.34 
 
 		 710 aa  499  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.26102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0097  hypothetical protein  40.27 
 
 		 719 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0544866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2277  hypothetical protein  39.48 
 
 		 720 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000453679  hitchhiker  0.0000445422 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2222  hypothetical protein  39.8 
 
 		 723 aa  465  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.747509  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2440  pentapeptide repeat protein  30.78 
 
 		 830 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3670  pentapeptide repeat protein  31.03 
 
 		 830 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.414516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  30.8 
 
 		 824 aa  227  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0969  hypothetical protein  30.1 
 
 		 726 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1013  hypothetical protein  30.1 
 
 		 726 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4009  putative ATP-dependent helicase  24.68 
 
 		 677 aa  97.4  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213516  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2943  putative DNA/RNA helicase  27.39 
 
 		 660 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0569603  unclonable  1.9165499999999998e-31 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0783  hypothetical protein  25.96 
 
 		 662 aa  91.7  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3306  hypothetical protein  26.86 
 
 		 662 aa  89.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000532342  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2003  putative ATP-dependent helicase  26.53 
 
 		 662 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.148023  hitchhiker  0.00375343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1094  hypothetical protein  27.14 
 
 		 588 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  24.25 
 
 		 612 aa  57  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  25.83 
 
 		 593 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  27.76 
 
 		 619 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4891  hypothetical protein  22.89 
 
 		 616 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.412698  normal  0.98473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  22.65 
 
 		 625 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  23.14 
 
 		 607 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  24.9 
 
 		 613 aa  44.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  22.86 
 
 		 634 aa  43.9  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  39.66 
 
 		 759 aa  43.9  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>