More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2219 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
327 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  65.91 
 
 
340 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  56.96 
 
 
353 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.31 
 
 
353 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.31 
 
 
353 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.31 
 
 
353 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  55.35 
 
 
357 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  55.99 
 
 
340 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  54.34 
 
 
360 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  54.22 
 
 
319 aa  360  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  54.49 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  54.49 
 
 
365 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  54.49 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  55.59 
 
 
359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  55.16 
 
 
338 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  53.44 
 
 
306 aa  350  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  51.91 
 
 
350 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  52.81 
 
 
308 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  52.96 
 
 
310 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  52.96 
 
 
310 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  51.8 
 
 
319 aa  345  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  53.62 
 
 
358 aa  344  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  56.54 
 
 
337 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  52.48 
 
 
308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  53.95 
 
 
358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  56.31 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  55.48 
 
 
342 aa  342  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  52.3 
 
 
306 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  56.31 
 
 
347 aa  342  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  52.48 
 
 
308 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  52.13 
 
 
306 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  55.02 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  53.35 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  55.34 
 
 
347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  55.34 
 
 
347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  55.34 
 
 
347 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  52.92 
 
 
334 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  51.64 
 
 
335 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  53.51 
 
 
312 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  48.56 
 
 
330 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  50.16 
 
 
334 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  50.16 
 
 
320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  48.24 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4458  bactoprenol glucosyl transferase  54.46 
 
 
309 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4543  bactoprenol glucosyl transferase  54.13 
 
 
309 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  54.13 
 
 
309 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0642  putative glycosyl transferase  51.64 
 
 
304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  52.65 
 
 
383 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  48.99 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  48.33 
 
 
339 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  49.01 
 
 
335 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  46.35 
 
 
348 aa  297  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  48.17 
 
 
337 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  48.33 
 
 
383 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  45.69 
 
 
332 aa  288  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  47.62 
 
 
367 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  44.55 
 
 
343 aa  286  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  44.14 
 
 
339 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  42.37 
 
 
346 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  46.67 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  44.04 
 
 
307 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.63 
 
 
332 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  48.68 
 
 
324 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 
339 aa  278  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  42.77 
 
 
319 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  44.37 
 
 
333 aa  277  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  43.33 
 
 
319 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  48.68 
 
 
324 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 
331 aa  275  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  44.59 
 
 
341 aa  275  9e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  44.12 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.79 
 
 
324 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  47.39 
 
 
339 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  49.67 
 
 
373 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  49.67 
 
 
373 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  44.69 
 
 
366 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  44.41 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  44.41 
 
 
311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0162  putative glycosyl transferase family protein  44.95 
 
 
316 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  45.78 
 
 
334 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  41.12 
 
 
324 aa  268  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  44.7 
 
 
330 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  44.04 
 
 
330 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  44.23 
 
 
364 aa  266  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  43.56 
 
 
312 aa  265  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  43.23 
 
 
312 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  46.08 
 
 
343 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2876  glycosyl transferase family 2  41.21 
 
 
320 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1679  glycosyl transferase family protein  44.76 
 
 
347 aa  261  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.64 
 
 
323 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  41.64 
 
 
323 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  41.64 
 
 
323 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 
345 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.64 
 
 
323 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  41.31 
 
 
323 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 
310 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0192  putative glycosyl transferase family protein  45.48 
 
 
310 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  41.69 
 
 
319 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2872  glycosyl transferase family 2  39.87 
 
 
336 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>