More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2216 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
432 aa  885    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  75.87 
 
 
431 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  71.39 
 
 
430 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  79.76 
 
 
434 aa  715    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  78.06 
 
 
437 aa  710    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0451  phosphopyruvate hydratase  72.27 
 
 
432 aa  620  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 
427 aa  578  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 
427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.5 
 
 
428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 
428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 
427 aa  569  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  65.42 
 
 
427 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  65.35 
 
 
430 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  63.32 
 
 
428 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 
427 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  64.25 
 
 
427 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  65.27 
 
 
429 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  64.57 
 
 
428 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 
427 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  65.42 
 
 
427 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  65.42 
 
 
427 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 
427 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  65.42 
 
 
427 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
427 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 
427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  64.8 
 
 
428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 
427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  65.12 
 
 
430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  63.55 
 
 
427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 
428 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  63.49 
 
 
429 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  65.24 
 
 
429 aa  558  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  64.95 
 
 
428 aa  558  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  63.59 
 
 
433 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  64.52 
 
 
429 aa  558  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  65.03 
 
 
428 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 
427 aa  557  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.39 
 
 
425 aa  556  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  64.44 
 
 
430 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  63.96 
 
 
427 aa  557  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 
427 aa  554  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 
425 aa  556  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  62.85 
 
 
427 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 
428 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1827  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 
426 aa  551  1e-156  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0530393  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  65.17 
 
 
431 aa  551  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  61.68 
 
 
427 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  62.79 
 
 
429 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  63.1 
 
 
433 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  64.05 
 
 
428 aa  549  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  63.48 
 
 
427 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  63.48 
 
 
427 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  61.81 
 
 
426 aa  548  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  62.09 
 
 
429 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0339  phosphopyruvate hydratase  65.29 
 
 
426 aa  545  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  63.94 
 
 
431 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  63.94 
 
 
431 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
431 aa  542  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  63.55 
 
 
427 aa  543  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
431 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
431 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
431 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
431 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  62.33 
 
 
430 aa  541  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
430 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  62.41 
 
 
431 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  62.77 
 
 
425 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  62.85 
 
 
426 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  63.48 
 
 
426 aa  538  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1794  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 
424 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181517  decreased coverage  0.000641423 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  62.05 
 
 
425 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3127  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  62.53 
 
 
424 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  62.05 
 
 
425 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3279  phosphopyruvate hydratase  63.36 
 
 
431 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.293287  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  61.15 
 
 
422 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1072  phosphopyruvate hydratase  63.25 
 
 
424 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800339  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1601  phosphopyruvate hydratase  63.96 
 
 
424 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0292189  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  63.25 
 
 
427 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  61.81 
 
 
425 aa  537  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2109  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 
424 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  65.95 
 
 
426 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1116  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
431 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4060  phosphopyruvate hydratase  63.01 
 
 
425 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1036  phosphopyruvate hydratase  62.88 
 
 
431 aa  537  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>