More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2213 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2213  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
359 aa  748    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1890  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.62 
 
 
358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.62 
 
 
357 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1907  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
356 aa  309  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000681421  unclonable  0.0000000000909138 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2140  Iron-containing alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 
357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.741299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2477  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.67 
 
 
356 aa  306  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2374  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000461423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2362  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
356 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000229628  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1852  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 
356 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318302  hitchhiker  0.00000012761 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2477  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  decreased coverage  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3202  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.83 
 
 
353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1985  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000240423  unclonable  0.00000000000340211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0804  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.66 
 
 
358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.94 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0108166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2183  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000901085  normal  0.0100031 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2126  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.11 
 
 
356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  unclonable  0.0000187018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2133  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.94 
 
 
356 aa  299  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000021113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2423  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.39 
 
 
356 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.195896  decreased coverage  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.11 
 
 
356 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000304818  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1640  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.11 
 
 
356 aa  296  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000263255  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10583  ethanolamine utilization protein-like protein  41.55 
 
 
614 aa  280  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2803  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.29 
 
 
365 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.54 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.17 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.32 
 
 
395 aa  116  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.39 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
384 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
398 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.32 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 
385 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.65 
 
 
381 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  33.8 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2525  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
383 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  28.17 
 
 
399 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.71 
 
 
400 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
400 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.48 
 
 
400 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
392 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
368 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.71 
 
 
400 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.79 
 
 
400 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.14 
 
 
400 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  30.95 
 
 
394 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
382 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.81 
 
 
388 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.81 
 
 
388 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 
388 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.14 
 
 
388 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0702  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.27 
 
 
386 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.82 
 
 
388 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.92 
 
 
382 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  29.92 
 
 
382 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
371 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 
389 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.04 
 
 
358 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2290  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
388 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.8 
 
 
384 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 
388 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.29 
 
 
400 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  31.75 
 
 
395 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  31.75 
 
 
395 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  31.43 
 
 
395 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  31.75 
 
 
395 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
395 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  31.75 
 
 
395 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.31 
 
 
388 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.43 
 
 
395 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  31.43 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  29.09 
 
 
383 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
395 aa  99  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13900  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 
386 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00279166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1048  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.5 
 
 
395 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155251  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.82 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 
386 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  30.96 
 
 
395 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
382 aa  98.6  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1971  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13542  normal  0.138356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
399 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.7 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
377 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.64 
 
 
383 aa  97.1  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  31.75 
 
 
395 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  31.75 
 
 
395 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.5 
 
 
872 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  31.75 
 
 
395 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
395 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  31.75 
 
 
395 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  31.75 
 
 
395 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.64 
 
 
388 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.74 
 
 
388 aa  96.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38750  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 
387 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.98 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.95 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  29.57 
 
 
369 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  31.18 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>