More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2204 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  100 
 
 
141 aa  293  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  54.62 
 
 
130 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
129 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  48 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  48.41 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.2 
 
 
128 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.2 
 
 
128 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.2 
 
 
128 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
138 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  41.6 
 
 
128 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  48.84 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  48.84 
 
 
149 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  48.84 
 
 
149 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  48.84 
 
 
149 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  48.84 
 
 
149 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  48.84 
 
 
334 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  45.9 
 
 
325 aa  97.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  40.48 
 
 
127 aa  97.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  47.24 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  43.7 
 
 
149 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  47.29 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 
147 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  48.06 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
136 aa  97.1  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  44.54 
 
 
329 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  44.54 
 
 
329 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  37.5 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  41.27 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 
153 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  42.5 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.65 
 
 
310 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  43.85 
 
 
316 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  42.5 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 
135 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  49.54 
 
 
166 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  41.54 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  42.48 
 
 
312 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  42.86 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  39.23 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
172 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  38.81 
 
 
153 aa  87  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
142 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
135 aa  87  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
139 aa  87  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
148 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  41.35 
 
 
314 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
136 aa  86.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.44 
 
 
313 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.35 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  35.66 
 
 
315 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  37.21 
 
 
130 aa  84.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  35.66 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  42.74 
 
 
314 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.94 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  44 
 
 
314 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  35.94 
 
 
316 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.69 
 
 
138 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
138 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  44.09 
 
 
315 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.01 
 
 
131 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  41.53 
 
 
314 aa  83.6  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.01 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.01 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  35.38 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  34.65 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  42.28 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>