More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2182 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
356 aa  716    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.48 
 
 
349 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  51.94 
 
 
345 aa  315  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  50.15 
 
 
344 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  43.36 
 
 
340 aa  259  7e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  40.29 
 
 
333 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  43.66 
 
 
341 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2620  glycosyl transferase family 2  39.59 
 
 
337 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 
338 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  38.8 
 
 
336 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.13 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  36.9 
 
 
339 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  36.5 
 
 
336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 
334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
334 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
347 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
361 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.79 
 
 
341 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
365 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
305 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
327 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
352 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
1250 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
353 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
363 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
336 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
367 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 
306 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.28 
 
 
367 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.62 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  30.28 
 
 
321 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
347 aa  95.5  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
274 aa  95.9  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.03 
 
 
377 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  29.31 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.74 
 
 
299 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
316 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  30.21 
 
 
294 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
334 aa  92.4  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
321 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
280 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  37.1 
 
 
291 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
294 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
300 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 
633 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
336 aa  89.7  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
296 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
308 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.92 
 
 
295 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
727 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
351 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  29.09 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
294 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 
230 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
337 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
233 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
324 aa  87  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
374 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
308 aa  87  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
364 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  29.58 
 
 
341 aa  85.9  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  43.1 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
609 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.81 
 
 
1099 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
235 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.97 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  43.55 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
663 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
752 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.03 
 
 
466 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
1015 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
1177 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
1177 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>