More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2175 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  100 
 
 
166 aa  331  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  64.05 
 
 
158 aa  175  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  64.84 
 
 
158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  64.06 
 
 
158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  63.49 
 
 
158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  53.28 
 
 
162 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  60.16 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  54.55 
 
 
147 aa  151  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  60 
 
 
165 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  43.14 
 
 
183 aa  147  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  52.59 
 
 
163 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  50 
 
 
163 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  48.67 
 
 
163 aa  141  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  51.43 
 
 
168 aa  140  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  50 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  46.76 
 
 
159 aa  138  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  48.61 
 
 
164 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  47.02 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  47.59 
 
 
164 aa  137  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  47.92 
 
 
165 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  47.92 
 
 
165 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  42.03 
 
 
170 aa  135  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  47.22 
 
 
164 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  48.89 
 
 
148 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  46.36 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  45.52 
 
 
518 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  44.83 
 
 
159 aa  131  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  41.96 
 
 
160 aa  130  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  42.95 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  42.95 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  40.88 
 
 
192 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  42.76 
 
 
167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  51.43 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  43.8 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  47.89 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  40.52 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  40.52 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  41.26 
 
 
159 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  43.8 
 
 
163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  43.07 
 
 
163 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  45.19 
 
 
218 aa  124  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  43.07 
 
 
161 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  41.01 
 
 
163 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  38.1 
 
 
165 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  43.07 
 
 
164 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  44.12 
 
 
150 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  47.22 
 
 
520 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  37.82 
 
 
171 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.34 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.46 
 
 
163 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.46 
 
 
163 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  42.34 
 
 
163 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  42.34 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  42.34 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.82 
 
 
171 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  42.34 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  45.99 
 
 
165 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.07 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  42.34 
 
 
164 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  37.76 
 
 
158 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  42.34 
 
 
164 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  42.34 
 
 
164 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  42.34 
 
 
164 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  40.74 
 
 
167 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  42.34 
 
 
164 aa  121  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  48.67 
 
 
533 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  40 
 
 
174 aa  120  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  41.61 
 
 
164 aa  120  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  41.48 
 
 
165 aa  120  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  39.31 
 
 
174 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  40.85 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  39.71 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  42.86 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  42.65 
 
 
150 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  39.71 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  39.71 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  41.48 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  47.62 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  40.74 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  40 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.18 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  37.18 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  40.13 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  46.32 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  37.18 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  37.18 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  40.14 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  40.74 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  40.91 
 
 
163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  34.97 
 
 
183 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  40.43 
 
 
164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  44.37 
 
 
157 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>